215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1497 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  41.26 
 
 		 1102 aa  771    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  42.68 
 
 		 1009 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  43.19 
 
 		 1063 aa  785    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1081 aa  766    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  45.61 
 
 		 1052 aa  845    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  42.9 
 
 		 1039 aa  746    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  51.74 
 
 		 1041 aa  990    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  38.18 
 
 		 984 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  41.55 
 
 		 1087 aa  763    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  45.4 
 
 		 1073 aa  779    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  40.21 
 
 		 1000 aa  649    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  40.82 
 
 		 1112 aa  746    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  100 
 
 		 1051 aa  2145    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  41.52 
 
 		 1060 aa  768    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  41.78 
 
 		 1069 aa  774    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  41.67 
 
 		 1027 aa  653    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  45.68 
 
 		 1039 aa  780    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  40.04 
 
 		 1007 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  43.3 
 
 		 1035 aa  753    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  44.03 
 
 		 1067 aa  810    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  42.88 
 
 		 1059 aa  777    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  44.35 
 
 		 1033 aa  751    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  40.4 
 
 		 1078 aa  680    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  49.83 
 
 		 905 aa  858    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  40.14 
 
 		 1029 aa  635  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  38.9 
 
 		 1085 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  38.75 
 
 		 1079 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  39.72 
 
 		 1022 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  36.61 
 
 		 1008 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  39.31 
 
 		 985 aa  596  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  35.57 
 
 		 1012 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  36.88 
 
 		 1142 aa  573  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  36.56 
 
 		 1010 aa  559  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  37 
 
 		 989 aa  560  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  35.28 
 
 		 1009 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  38.91 
 
 		 965 aa  557  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  36.73 
 
 		 991 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  37.82 
 
 		 1067 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  36.49 
 
 		 971 aa  554  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  38.1 
 
 		 992 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  35.85 
 
 		 1004 aa  546  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  38.73 
 
 		 1006 aa  535  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  36.12 
 
 		 1011 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  36.84 
 
 		 997 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  34.73 
 
 		 1034 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  35.64 
 
 		 1016 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  34.79 
 
 		 999 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  32.75 
 
 		 969 aa  490  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  33.95 
 
 		 983 aa  488  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  35.57 
 
 		 990 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  31.56 
 
 		 1035 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  35.48 
 
 		 1022 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  35.26 
 
 		 1023 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  37.09 
 
 		 1002 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  36.93 
 
 		 976 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  36.19 
 
 		 1023 aa  462  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1031 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.03 
 
 		 1044 aa  125  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1092  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.16 
 
 		 965 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.20335  normal  0.270177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2224  hypothetical protein  48.41 
 
 		 155 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0536886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.45 
 
 		 1031 aa  112  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.4 
 
 		 1040 aa  109  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2687  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.83 
 
 		 979 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1898  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.91 
 
 		 981 aa  105  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3150  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.19 
 
 		 1000 aa  104  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1175  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.13 
 
 		 980 aa  104  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.770188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2912  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.42 
 
 		 1045 aa  104  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.51 
 
 		 1032 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1156  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.8 
 
 		 974 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  25.19 
 
 		 1051 aa  103  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3606  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.52 
 
 		 1000 aa  103  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1807  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.04 
 
 		 982 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.71292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0939  hypothetical protein  31.16 
 
 		 313 aa  102  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.702425 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.61 
 
 		 1067 aa  101  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.71 
 
 		 1034 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3110  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.38 
 
 		 980 aa  100  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.2 
 
 		 1042 aa  100  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.42 
 
 		 1035 aa  100  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2218  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.23 
 
 		 975 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1568  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.1 
 
 		 982 aa  100  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0336191  unclonable  0.0000249551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3172  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.89 
 
 		 995 aa  99.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000000957293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2281  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.23 
 
 		 986 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000865916 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.32 
 
 		 1032 aa  99  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.2 
 
 		 1079 aa  98.2  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.19 
 
 		 1060 aa  98.2  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0608  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.96 
 
 		 1006 aa  97.8  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2507  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.88 
 
 		 1068 aa  96.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351896  normal  0.319546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1670  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.41 
 
 		 965 aa  97.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000414451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24 
 
 		 1044 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3013  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.04 
 
 		 1070 aa  96.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.36517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0841  type I restriction-modification system, R subunit  25.39 
 
 		 973 aa  95.9  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0969  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.39 
 
 		 973 aa  95.9  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.301095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0843  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.45 
 
 		 993 aa  95.9  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  23.53 
 
 		 1289 aa  95.9  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0281  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.64 
 
 		 1028 aa  95.5  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000241298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2923  R (restriction) subunit/helicase  24.19 
 
 		 984 aa  95.1  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0380  type I restriction-modification system, R subunit  23.33 
 
 		 1033 aa  95.1  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.16 
 
 		 1345 aa  95.1  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.34 
 
 		 1372 aa  94.7  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.4 
 
 		 1053 aa  94.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>