236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0749 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 992 aa  2050    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  42.26 
 
 		 989 aa  749    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  44.71 
 
 		 965 aa  789    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  39.92 
 
 		 1004 aa  659    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  42.74 
 
 		 1009 aa  715    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1008 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  39.53 
 
 		 1027 aa  665    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  40.71 
 
 		 1016 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  39.88 
 
 		 997 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1022 aa  676    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  47.78 
 
 		 984 aa  940    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  38.88 
 
 		 999 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  39.58 
 
 		 985 aa  670    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  39.36 
 
 		 1010 aa  645    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  38.01 
 
 		 991 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  39.86 
 
 		 1011 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  44.3 
 
 		 1000 aa  771    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  39.38 
 
 		 1029 aa  678    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  40.94 
 
 		 1012 aa  703    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  41.78 
 
 		 1007 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  40.2 
 
 		 1035 aa  659    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  36.69 
 
 		 990 aa  644    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  39.78 
 
 		 971 aa  696    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  39.35 
 
 		 1009 aa  663    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  40.02 
 
 		 1052 aa  635  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  40.56 
 
 		 1034 aa  628  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  39.17 
 
 		 1023 aa  623  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  39.43 
 
 		 1022 aa  621  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  37.74 
 
 		 1031 aa  616  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  36.66 
 
 		 983 aa  619  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  38.06 
 
 		 1023 aa  610  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1039 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  37.69 
 
 		 1006 aa  607  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  37.35 
 
 		 1002 aa  602  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  36.29 
 
 		 969 aa  602  1e-170  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  38.24 
 
 		 1067 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  36.53 
 
 		 1067 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  40.59 
 
 		 905 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  41.11 
 
 		 976 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1059 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1060 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  36.54 
 
 		 1039 aa  569  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  37.23 
 
 		 1081 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1069 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  38.41 
 
 		 1051 aa  561  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1033 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  38.59 
 
 		 1041 aa  557  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  36.45 
 
 		 1087 aa  557  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  36.37 
 
 		 1102 aa  553  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  34.9 
 
 		 1112 aa  554  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  35.6 
 
 		 1063 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  36.22 
 
 		 1078 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  37.6 
 
 		 1073 aa  528  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  35.4 
 
 		 1085 aa  506  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  34.17 
 
 		 1079 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  31.8 
 
 		 1142 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  27.95 
 
 		 1035 aa  345  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  26.69 
 
 		 1289 aa  122  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.76 
 
 		 1023 aa  112  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.09 
 
 		 1024 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0874  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.8 
 
 		 1041 aa  111  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0948  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  22.42 
 
 		 1030 aa  107  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000221808  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.33 
 
 		 1084 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3549  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.49 
 
 		 1092 aa  106  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.254191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  24.13 
 
 		 1051 aa  104  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04460  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.51 
 
 		 1010 aa  103  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.01 
 
 		 1031 aa  102  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.51 
 
 		 1032 aa  102  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2923  R (restriction) subunit/helicase  26.77 
 
 		 984 aa  101  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0157  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.9 
 
 		 1096 aa  101  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.61 
 
 		 1044 aa  101  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.73 
 
 		 1084 aa  101  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.91 
 
 		 1079 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3424  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.98 
 
 		 984 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.82 
 
 		 1003 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.97 
 
 		 1029 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.08 
 
 		 1032 aa  100  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3013  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.43 
 
 		 1070 aa  99.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.36517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  24.01 
 
 		 1044 aa  99  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2687  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.53 
 
 		 979 aa  98.6  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.1 
 
 		 1074 aa  97.8  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.65 
 
 		 1035 aa  97.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2327  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.85 
 
 		 1046 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.279582  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.65 
 
 		 1060 aa  97.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7554  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.57 
 
 		 1072 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.55 
 
 		 1003 aa  95.9  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.1 
 
 		 1067 aa  95.5  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2012  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.04 
 
 		 1046 aa  95.5  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.599838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3172  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.52 
 
 		 995 aa  94  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000000957293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2256  type I restriction-modification system, R subunit  24.17 
 
 		 1061 aa  94.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1807  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.16 
 
 		 982 aa  93.2  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.71292 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1115  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.54 
 
 		 1107 aa  93.6  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.16 
 
 		 1042 aa  92.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2674  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.88 
 
 		 1027 aa  92  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2413  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.76 
 
 		 1022 aa  91.7  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.623106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1362  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.19 
 
 		 1060 aa  92  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.76 
 
 		 1022 aa  91.7  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0881  putative type I site specific deoxyribonuclease HsdR  24.24 
 
 		 1060 aa  91.3  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0350782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3606  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.52 
 
 		 1000 aa  90.9  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0843  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.3 
 
 		 993 aa  90.1  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>