242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1789 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  39.22 
 
 		 1102 aa  665    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1081 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  43.04 
 
 		 965 aa  750    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  54.3 
 
 		 1009 aa  1089    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  40.13 
 
 		 1010 aa  744    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  40 
 
 		 1063 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  41.61 
 
 		 984 aa  785    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  47.66 
 
 		 1000 aa  920    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  41.87 
 
 		 985 aa  734    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  42.99 
 
 		 905 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  39.93 
 
 		 1039 aa  655    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  39.38 
 
 		 992 aa  670    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  51.43 
 
 		 1027 aa  989    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  42.62 
 
 		 989 aa  765    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  86.51 
 
 		 1022 aa  1832    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  42.3 
 
 		 1052 aa  731    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  40.44 
 
 		 1004 aa  660    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  42.44 
 
 		 1012 aa  793    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1029 aa  2127    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  39 
 
 		 1009 aa  728    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  42.6 
 
 		 1006 aa  729    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  52.2 
 
 		 1008 aa  1036    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  38.03 
 
 		 1112 aa  658    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  39.69 
 
 		 1060 aa  672    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1069 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1039 aa  638    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  55.07 
 
 		 1007 aa  1086    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1035 aa  808    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  37.34 
 
 		 971 aa  659    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  39.8 
 
 		 1059 aa  671    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  40.07 
 
 		 1067 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  42.15 
 
 		 1033 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  38.85 
 
 		 1087 aa  632  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  40.14 
 
 		 1051 aa  628  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  39.59 
 
 		 1067 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  38.5 
 
 		 991 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  41.42 
 
 		 1041 aa  611  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  37.81 
 
 		 1073 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  36.19 
 
 		 997 aa  589  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  36.23 
 
 		 990 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  36.37 
 
 		 1078 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  37.41 
 
 		 983 aa  568  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  37.75 
 
 		 999 aa  562  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  35.22 
 
 		 1085 aa  559  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  35.57 
 
 		 969 aa  553  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  36.06 
 
 		 1011 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  34.68 
 
 		 1079 aa  549  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  39.04 
 
 		 976 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  36.63 
 
 		 1016 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1031 aa  524  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  35.02 
 
 		 1023 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  34.86 
 
 		 1023 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  35.65 
 
 		 1002 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  34.89 
 
 		 1022 aa  515  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  32.5 
 
 		 1034 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  32.07 
 
 		 1142 aa  468  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  29.13 
 
 		 1035 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.16 
 
 		 1003 aa  118  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  26.27 
 
 		 967 aa  118  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  26.11 
 
 		 967 aa  118  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.93 
 
 		 1053 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  26.82 
 
 		 1040 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.91 
 
 		 1032 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.3 
 
 		 1044 aa  115  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.76 
 
 		 1032 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.4 
 
 		 1074 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1863  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.27 
 
 		 855 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.79 
 
 		 1034 aa  112  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1854  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.23 
 
 		 1026 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3386  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.38 
 
 		 1052 aa  110  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0011  type I site-specific deoxyribonuclease  26.91 
 
 		 1061 aa  110  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0222  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  27.29 
 
 		 1028 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.64 
 
 		 1044 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.63 
 
 		 1067 aa  110  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.77 
 
 		 1003 aa  109  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0948  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.55 
 
 		 1030 aa  109  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000221808  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1804  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  26.36 
 
 		 1068 aa  108  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0101  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.9 
 
 		 986 aa  108  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.39 
 
 		 1031 aa  107  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.2 
 
 		 1029 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.4 
 
 		 1084 aa  107  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  22.6 
 
 		 1023 aa  107  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.19 
 
 		 1060 aa  107  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  26.63 
 
 		 1051 aa  106  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0608  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.41 
 
 		 1006 aa  106  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2596  type I restriction-modification system, R subunit  23.66 
 
 		 1059 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.16 
 
 		 1079 aa  105  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3082  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.32 
 
 		 1085 aa  105  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3013  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.33 
 
 		 1070 aa  105  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.36517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4782  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.34 
 
 		 1029 aa  104  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2793  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.3 
 
 		 1012 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2012  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.85 
 
 		 1046 aa  104  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.599838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3549  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.6 
 
 		 1092 aa  103  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.254191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.96 
 
 		 1042 aa  102  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2912  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.12 
 
 		 1045 aa  101  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.19 
 
 		 1040 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0874  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.89 
 
 		 1041 aa  100  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.39 
 
 		 1044 aa  100  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  24.34 
 
 		 1289 aa  100  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1790  restriction enzyme  24.46 
 
 		 1072 aa  99.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>