241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13690 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  41.92 
 
 		 1102 aa  713    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  43.79 
 
 		 1052 aa  768    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  39.59 
 
 		 1063 aa  689    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  43.59 
 
 		 1039 aa  766    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  45.4 
 
 		 1041 aa  780    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  40.32 
 
 		 1112 aa  723    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  40.8 
 
 		 1081 aa  714    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  41.18 
 
 		 1078 aa  666    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  48.81 
 
 		 905 aa  784    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  41.25 
 
 		 1087 aa  703    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  45.02 
 
 		 1051 aa  782    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  40.31 
 
 		 1060 aa  688    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  41.01 
 
 		 1069 aa  693    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  43.66 
 
 		 1039 aa  771    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  41.27 
 
 		 1035 aa  705    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  100 
 
 		 1073 aa  2209    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  41.13 
 
 		 1059 aa  716    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  41.98 
 
 		 1067 aa  712    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  43.22 
 
 		 1033 aa  744    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  37.73 
 
 		 1000 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  39.94 
 
 		 1027 aa  632  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  37 
 
 		 1008 aa  613  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  38.43 
 
 		 1085 aa  612  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  37.83 
 
 		 1029 aa  612  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  38.36 
 
 		 1009 aa  608  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  38.92 
 
 		 1007 aa  605  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  38.26 
 
 		 1022 aa  598  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  38.28 
 
 		 1079 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  37.6 
 
 		 1004 aa  580  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  39.46 
 
 		 985 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  36.8 
 
 		 1012 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  37.09 
 
 		 984 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  37.95 
 
 		 989 aa  557  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  36.94 
 
 		 1010 aa  551  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  37.28 
 
 		 1067 aa  542  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  37.09 
 
 		 1009 aa  536  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  38.91 
 
 		 1006 aa  532  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  37.81 
 
 		 992 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  37.06 
 
 		 965 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  35.89 
 
 		 1142 aa  508  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  35.15 
 
 		 991 aa  508  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  34.28 
 
 		 990 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  35.25 
 
 		 1011 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  35.32 
 
 		 971 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  34.54 
 
 		 999 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  35.31 
 
 		 997 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  35.52 
 
 		 1016 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  34.03 
 
 		 983 aa  473  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  34.12 
 
 		 1023 aa  469  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  33.85 
 
 		 1034 aa  466  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  31.86 
 
 		 969 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  34.14 
 
 		 1023 aa  453  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  33.87 
 
 		 1022 aa  452  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  36.12 
 
 		 1002 aa  446  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  37.63 
 
 		 976 aa  438  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  30.41 
 
 		 1035 aa  439  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  33.63 
 
 		 1031 aa  439  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.86 
 
 		 1074 aa  139  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.52 
 
 		 1044 aa  127  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.08 
 
 		 1032 aa  125  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.14 
 
 		 1032 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.31 
 
 		 1034 aa  122  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1124  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  22.97 
 
 		 1084 aa  119  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.35 
 
 		 1031 aa  119  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.98 
 
 		 1067 aa  118  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0011  type I site-specific deoxyribonuclease  24.93 
 
 		 1061 aa  114  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386666 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.92 
 
 		 1023 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2413  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.78 
 
 		 1022 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.623106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.78 
 
 		 1022 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.59 
 
 		 1053 aa  112  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.81 
 
 		 1042 aa  111  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.72 
 
 		 1079 aa  111  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  24.46 
 
 		 1040 aa  111  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4782  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25 
 
 		 1029 aa  110  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.36 
 
 		 1035 aa  108  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2923  R (restriction) subunit/helicase  23.91 
 
 		 984 aa  106  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0101  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.44 
 
 		 986 aa  107  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.31 
 
 		 1003 aa  106  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0948  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.56 
 
 		 1030 aa  106  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000221808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4010  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.43 
 
 		 1067 aa  106  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.45 
 
 		 1044 aa  106  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3424  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.68 
 
 		 984 aa  105  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2909  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.6 
 
 		 1042 aa  105  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2596  type I restriction-modification system, R subunit  22.42 
 
 		 1059 aa  104  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2450  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR family  23.66 
 
 		 1042 aa  104  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0222  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.92 
 
 		 1028 aa  104  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2912  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.56 
 
 		 1045 aa  103  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1863  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.11 
 
 		 855 aa  103  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.12 
 
 		 1003 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1854  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.12 
 
 		 1026 aa  102  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.82 
 
 		 1060 aa  101  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1790  restriction enzyme  24.53 
 
 		 1072 aa  101  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.3 
 
 		 1084 aa  101  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3172  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.37 
 
 		 995 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000000957293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1093  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.52 
 
 		 1074 aa  100  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.38 
 
 		 1040 aa  100  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1804  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.46 
 
 		 1068 aa  99.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0281  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.86 
 
 		 1028 aa  99.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000241298 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.08 
 
 		 1024 aa  99.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2224  hypothetical protein  41.94 
 
 		 155 aa  98.2  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0536886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>