69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0160 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  38.14 
 
 		 1067 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  100 
 
 		 1035 aa  2156    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  38.19 
 
 		 1063 aa  701    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  44.06 
 
 		 1052 aa  872    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  36.37 
 
 		 1081 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  40.21 
 
 		 1059 aa  747    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  38.09 
 
 		 1069 aa  700    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  38.28 
 
 		 1060 aa  693    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  35.8 
 
 		 1087 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  34.26 
 
 		 1112 aa  624  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  34.36 
 
 		 1102 aa  605  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1039 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  33.27 
 
 		 1035 aa  542  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  32.67 
 
 		 1039 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  31.1 
 
 		 1079 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  30.22 
 
 		 1078 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1033 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  30.71 
 
 		 1085 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  31.38 
 
 		 1051 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  33.52 
 
 		 905 aa  459  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1041 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  30.08 
 
 		 1000 aa  448  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  30.23 
 
 		 1027 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  30.98 
 
 		 1009 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  30.41 
 
 		 1073 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1007 aa  412  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  29.13 
 
 		 1029 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  33.17 
 
 		 1012 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  30.76 
 
 		 1022 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1008 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  31.58 
 
 		 985 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  29.42 
 
 		 1004 aa  381  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  29.73 
 
 		 1006 aa  375  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  29.49 
 
 		 984 aa  365  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  29.63 
 
 		 989 aa  361  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  30.93 
 
 		 1009 aa  350  9e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 		 1010 aa  340  8e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  27.82 
 
 		 991 aa  337  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  31.36 
 
 		 992 aa  333  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  27.98 
 
 		 1067 aa  331  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  28.83 
 
 		 965 aa  326  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  30.24 
 
 		 976 aa  312  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  27.82 
 
 		 999 aa  311  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  28.46 
 
 		 990 aa  311  5.9999999999999995e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  28.84 
 
 		 971 aa  310  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  27.3 
 
 		 983 aa  303  9e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  26.55 
 
 		 997 aa  300  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  29.21 
 
 		 1011 aa  297  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  28.27 
 
 		 1016 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  27.35 
 
 		 1023 aa  277  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  27.28 
 
 		 1002 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  27.58 
 
 		 1022 aa  275  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  27.48 
 
 		 1023 aa  275  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  26.32 
 
 		 1034 aa  274  8.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  27.95 
 
 		 969 aa  269  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1031 aa  267  5.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  29.11 
 
 		 1142 aa  261  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0939  hypothetical protein  26.06 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.702425 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1092  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  20.76 
 
 		 965 aa  55.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.20335  normal  0.270177 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  20.25 
 
 		 1067 aa  55.1  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  20.97 
 
 		 1024 aa  52.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  20.64 
 
 		 1023 aa  49.7  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  21.64 
 
 		 1289 aa  49.7  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2224  hypothetical protein  28.08 
 
 		 155 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0536886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04460  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.67 
 
 		 1010 aa  48.9  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  21.98 
 
 		 1053 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1093  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.58 
 
 		 1074 aa  47  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2012  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.69 
 
 		 1046 aa  45.8  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.599838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4301  hypothetical protein  23.46 
 
 		 793 aa  44.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.355479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>