240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1151 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  42.76 
 
 		 1051 aa  771    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  37.19 
 
 		 1012 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  41.63 
 
 		 1079 aa  771    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  49.36 
 
 		 1102 aa  1067    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  42 
 
 		 1009 aa  723    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  40.21 
 
 		 1035 aa  747    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  69.34 
 
 		 1063 aa  1517    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  51.99 
 
 		 1112 aa  1116    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  53.34 
 
 		 1081 aa  1121    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  42.3 
 
 		 1027 aa  755    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  42.67 
 
 		 1085 aa  794    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  40.85 
 
 		 1073 aa  700    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  37.26 
 
 		 984 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  45.46 
 
 		 1039 aa  841    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  43.19 
 
 		 1041 aa  739    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  38.44 
 
 		 1008 aa  684    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  41.37 
 
 		 1000 aa  764    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  40.76 
 
 		 1022 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  70.79 
 
 		 1067 aa  1557    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  40.55 
 
 		 985 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  45.44 
 
 		 1033 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  39.8 
 
 		 1029 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  40.53 
 
 		 1078 aa  791    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  51.89 
 
 		 1087 aa  1105    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  46.88 
 
 		 905 aa  771    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  71.1 
 
 		 1060 aa  1582    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  71.58 
 
 		 1069 aa  1595    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  46.23 
 
 		 1039 aa  876    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1007 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  43.52 
 
 		 1035 aa  835    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  58.27 
 
 		 1052 aa  1186    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  100 
 
 		 1059 aa  2184    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  37.86 
 
 		 989 aa  626  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  36.08 
 
 		 1009 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  38.06 
 
 		 1004 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  38.64 
 
 		 1006 aa  610  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  37.06 
 
 		 1142 aa  606  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  38.62 
 
 		 1067 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  34.87 
 
 		 1010 aa  595  1e-168  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  37.66 
 
 		 965 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  36.21 
 
 		 992 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  35.15 
 
 		 971 aa  556  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  35.63 
 
 		 991 aa  535  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  37.04 
 
 		 1011 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  36.02 
 
 		 999 aa  532  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  35.65 
 
 		 1023 aa  532  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  35.55 
 
 		 1022 aa  526  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  35.51 
 
 		 997 aa  522  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  37.8 
 
 		 1016 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  34.27 
 
 		 969 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  35.76 
 
 		 1034 aa  491  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  33.36 
 
 		 990 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  40.28 
 
 		 976 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  34.04 
 
 		 983 aa  482  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  34.71 
 
 		 1002 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  33.43 
 
 		 1023 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1031 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.1 
 
 		 1032 aa  126  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.48 
 
 		 1032 aa  125  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.78 
 
 		 1053 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.13 
 
 		 1031 aa  124  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  27.26 
 
 		 1051 aa  122  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.05 
 
 		 1044 aa  121  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.83 
 
 		 1003 aa  120  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.24 
 
 		 1003 aa  121  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.12 
 
 		 1079 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  25.67 
 
 		 1044 aa  118  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.3 
 
 		 1023 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.71 
 
 		 1060 aa  117  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2413  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.48 
 
 		 1022 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.623106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.48 
 
 		 1022 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.44 
 
 		 1084 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.41 
 
 		 1035 aa  112  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2507  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.37 
 
 		 1068 aa  112  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351896  normal  0.319546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0939  hypothetical protein  32.98 
 
 		 313 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.702425 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0948  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  22.49 
 
 		 1030 aa  110  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000221808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4010  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.19 
 
 		 1067 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.68 
 
 		 1074 aa  109  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2012  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.74 
 
 		 1046 aa  109  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.599838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0874  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.73 
 
 		 1041 aa  108  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.12 
 
 		 1044 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.51 
 
 		 1040 aa  108  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.14 
 
 		 1024 aa  108  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.5 
 
 		 1042 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175068  normal  0.39911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4929  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1088 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.806169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1863  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.82 
 
 		 855 aa  107  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3013  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.38 
 
 		 1070 aa  106  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.36517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0881  putative type I site specific deoxyribonuclease HsdR  23.72 
 
 		 1060 aa  106  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0350782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3172  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.01 
 
 		 995 aa  106  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000000957293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.69 
 
 		 1029 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.07 
 
 		 1084 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7554  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.55 
 
 		 1072 aa  104  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2450  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR family  26.17 
 
 		 1042 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0011  type I site-specific deoxyribonuclease  25.93 
 
 		 1061 aa  104  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386666 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.42 
 
 		 967 aa  103  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0380  type I restriction-modification system, R subunit  23.01 
 
 		 1033 aa  103  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2923  R (restriction) subunit/helicase  25.33 
 
 		 984 aa  103  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0222  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  26.34 
 
 		 1028 aa  103  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.42 
 
 		 967 aa  103  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4782  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.88 
 
 		 1029 aa  103  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>