225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00390 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
203 aa  399  1e-110  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  58.79 
 
 
203 aa  215  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  53.96 
 
 
203 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  54.77 
 
 
539 aa  201  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  50.75 
 
 
553 aa  187  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  50.75 
 
 
541 aa  187  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  48.74 
 
 
549 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  51.26 
 
 
531 aa  185  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  52.45 
 
 
205 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  51.47 
 
 
522 aa  183  1e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  51.23 
 
 
518 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  50.75 
 
 
204 aa  179  3e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  48.48 
 
 
201 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  45.5 
 
 
534 aa  173  2e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  47.24 
 
 
539 aa  172  2e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  49.05 
 
 
235 aa  172  4e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  47.76 
 
 
555 aa  171  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  47.24 
 
 
536 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  45.06 
 
 
248 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  47.12 
 
 
233 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  48.04 
 
 
221 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  48.04 
 
 
221 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  48.04 
 
 
221 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  47.52 
 
 
204 aa  166  3e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  47.72 
 
 
562 aa  165  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  48.56 
 
 
539 aa  162  4e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  49.75 
 
 
200 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  44.78 
 
 
209 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  45.81 
 
 
212 aa  147  1e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  50.81 
 
 
571 aa  147  2e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  1.7266e-05 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  46.23 
 
 
219 aa  146  2e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  41.67 
 
 
592 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  50.89 
 
 
222 aa  141  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  45.7 
 
 
215 aa  141  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  43.98 
 
 
216 aa  139  2e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  47.96 
 
 
585 aa  140  2e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  43.46 
 
 
218 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  42.33 
 
 
564 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  43.55 
 
 
215 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  43.55 
 
 
215 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  54.55 
 
 
510 aa  133  2e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  40.8 
 
 
217 aa  132  4e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  43.84 
 
 
203 aa  132  4e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  40.85 
 
 
215 aa  131  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  43.09 
 
 
216 aa  131  7e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  41.35 
 
 
229 aa  130  1e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  41.06 
 
 
217 aa  128  4e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  38.79 
 
 
249 aa  125  4e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  39.42 
 
 
217 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 
258 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  40.47 
 
 
218 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  36.62 
 
 
246 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  42.53 
 
 
217 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  38.46 
 
 
201 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  34.58 
 
 
238 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  39.9 
 
 
230 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  41.12 
 
 
234 aa  120  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  35.24 
 
 
226 aa  120  1e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  6.02904e-05 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  38.83 
 
 
256 aa  120  1e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  37.44 
 
 
218 aa  120  2e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  37.38 
 
 
244 aa  120  2e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  38.12 
 
 
219 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  52.54 
 
 
247 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  36.95 
 
 
218 aa  119  4e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 
233 aa  119  4e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.91255e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  38.35 
 
 
259 aa  118  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  36.95 
 
 
218 aa  118  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  38.6 
 
 
231 aa  118  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  38.35 
 
 
256 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  38.35 
 
 
256 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  38.35 
 
 
218 aa  117  8e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  38.35 
 
 
218 aa  117  8e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  38.35 
 
 
218 aa  117  8e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  38.35 
 
 
218 aa  117  8e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  41 
 
 
257 aa  117  1e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  37.44 
 
 
218 aa  117  1e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  37.44 
 
 
218 aa  117  1e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  37.44 
 
 
218 aa  117  1e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  37.44 
 
 
218 aa  117  1e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  37.44 
 
 
218 aa  117  1e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  36.7 
 
 
242 aa  117  1e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  37.44 
 
 
218 aa  117  1e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  37.44 
 
 
218 aa  117  1e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  36.82 
 
 
218 aa  117  2e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  37.31 
 
 
218 aa  117  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  37.31 
 
 
218 aa  117  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  37.31 
 
 
218 aa  117  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  36.82 
 
 
218 aa  116  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  37.31 
 
 
218 aa  117  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  37.44 
 
 
218 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  36.95 
 
 
218 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  39.44 
 
 
243 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  35.42 
 
 
220 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  38.39 
 
 
218 aa  114  8e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  38.39 
 
 
218 aa  114  8e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  38.39 
 
 
218 aa  114  9e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  35.81 
 
 
243 aa  114  1e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  38.39 
 
 
218 aa  114  1e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  30.59 
 
 
229 aa  114  1e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  38.39 
 
 
218 aa  113  2e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>