251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3406 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 346 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.51 
 
 		 337 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.32 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.45 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.13 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  60.06 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  61.34 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.54 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.58 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  59.01 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  59.71 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  58.55 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  57.73 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  58.26 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  58.72 
 
 		 339 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  58.21 
 
 		 339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  57.97 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.67 
 
 		 340 aa  359  4e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  59.37 
 
 		 337 aa  359  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.1 
 
 		 340 aa  352  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  56.4 
 
 		 341 aa  352  5.9999999999999994e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.06 
 
 		 341 aa  346  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.73 
 
 		 339 aa  342  8e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.09 
 
 		 346 aa  339  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.69 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.3 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.29 
 
 		 350 aa  328  9e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  52.17 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  52.57 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  52.57 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  52.57 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.76 
 
 		 344 aa  322  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  53.03 
 
 		 343 aa  322  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  52.16 
 
 		 343 aa  316  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.09 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.56 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  44.47 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.9 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.39 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  37.98 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.82 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.11 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  34.68 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.71 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  32.2 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  32.2 
 
 		 339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  31.52 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  28.94 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.46 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  37.76 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.57 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.14 
 
 		 351 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.99 
 
 		 343 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.67 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.91 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.74 
 
 		 348 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.88 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  34.94 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.28 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 359 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.61 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  35.14 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.71 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.61 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.61 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.87 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  34.48 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.22 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  34.46 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  33.98 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.88 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.68 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  27.54 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  34.29 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.47 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  32.39 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  33.71 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  27.99 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  27.99 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.78 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  32.51 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  27.27 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  27.3 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  32.86 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.94 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.51 
 
 		 376 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  27.3 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  27.54 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  27.54 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.61 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 362 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>