126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0547 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  100 
 
 		 183 aa  347  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  63.69 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  62.5 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  55.13 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  57.23 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  57.67 
 
 		 171 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  51.52 
 
 		 170 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  52.73 
 
 		 161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  48.75 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  45.34 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  48.54 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  63.04 
 
 		 150 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  66.3 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  61.62 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  55.14 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  37.17 
 
 		 190 aa  104  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  53.93 
 
 		 148 aa  98.6  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  41.55 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  34.84 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  40.17 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  34.48 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  26.71 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  26.03 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  32.79 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  26.71 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  26.71 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  26.71 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  37.74 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  26.71 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  40.91 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  26.71 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  24.66 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  28.28 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  41.57 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  32.18 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  29.07 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  29.07 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  36.05 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  29.07 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  29.07 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  29.07 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  29.07 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  29.07 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  32.35 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  29.07 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  27.91 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  29.07 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  37.97 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  36.05 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  38.16 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  37.89 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  40.51 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  43.84 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  33.94 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  32.18 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  29.33 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  34.91 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  27.71 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  42.35 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  27.03 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  39.77 
 
 		 491 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  25.71 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  26.38 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  37.04 
 
 		 558 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  29.58 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  33.57 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  30.11 
 
 		 609 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  40.85 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  40.85 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  35.56 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  41.67 
 
 		 555 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  49.02 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  27.94 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  38.89 
 
 		 530 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  43.86 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  34.23 
 
 		 488 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  32.23 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  35.14 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  44.64 
 
 		 551 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  32.38 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  31.43 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  40.28 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  31.37 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  41.1 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  28.75 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  33.71 
 
 		 632 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  37.84 
 
 		 646 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  42.03 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  42.86 
 
 		 521 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  27.4 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  34.21 
 
 		 619 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  38.98 
 
 		 550 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  30.34 
 
 		 494 aa  45.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  29.93 
 
 		 579 aa  44.7  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  39.73 
 
 		 766 aa  44.3  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  44.44 
 
 		 489 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  30.47 
 
 		 549 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>