More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1728 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  57.85 
 
 		 562 aa  691    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  57.83 
 
 		 551 aa  665    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  57.82 
 
 		 548 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  59.41 
 
 		 567 aa  700    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  58.88 
 
 		 572 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  60.96 
 
 		 577 aa  704    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  73.71 
 
 		 588 aa  918    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  59.93 
 
 		 606 aa  703    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  66.49 
 
 		 616 aa  798    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  100 
 
 		 585 aa  1217    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  63.91 
 
 		 598 aa  779    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  61.69 
 
 		 601 aa  712    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  54 
 
 		 551 aa  635    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  58.81 
 
 		 574 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  61.55 
 
 		 601 aa  708    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  59.13 
 
 		 591 aa  713    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  68.65 
 
 		 583 aa  833    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  57.51 
 
 		 682 aa  699    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  68.05 
 
 		 567 aa  808    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  56.32 
 
 		 582 aa  665    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  56.15 
 
 		 556 aa  638    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  61.51 
 
 		 596 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  59.03 
 
 		 610 aa  704    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  59.71 
 
 		 604 aa  704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  56 
 
 		 558 aa  639    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  55.78 
 
 		 553 aa  635    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  74.64 
 
 		 591 aa  879    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  61.51 
 
 		 596 aa  707    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  64.27 
 
 		 598 aa  781    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  61.55 
 
 		 556 aa  713    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  75.91 
 
 		 587 aa  871    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  59.75 
 
 		 571 aa  699    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  61.51 
 
 		 596 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  55.95 
 
 		 572 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  53.41 
 
 		 1114 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  55.58 
 
 		 1119 aa  634  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  53.65 
 
 		 1121 aa  633  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  57.48 
 
 		 572 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  57.67 
 
 		 553 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  53.03 
 
 		 1088 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  53.03 
 
 		 1088 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  56.3 
 
 		 1110 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  55.58 
 
 		 1108 aa  628  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  52.84 
 
 		 1088 aa  627  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  53.76 
 
 		 1088 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  53.39 
 
 		 1088 aa  623  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  54.04 
 
 		 1100 aa  623  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  54.99 
 
 		 1115 aa  622  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  52.81 
 
 		 1092 aa  623  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  54.24 
 
 		 1112 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  53.11 
 
 		 1112 aa  618  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  53.1 
 
 		 1123 aa  620  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  53.37 
 
 		 1121 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  54.03 
 
 		 1111 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  54.16 
 
 		 1102 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  53.62 
 
 		 1104 aa  616  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  54.16 
 
 		 1102 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  53.35 
 
 		 1113 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  54.16 
 
 		 1102 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  55.43 
 
 		 1101 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  53.93 
 
 		 1130 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  53.57 
 
 		 1106 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  53.32 
 
 		 1106 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  52.89 
 
 		 1108 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  54.17 
 
 		 1164 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  52.29 
 
 		 1109 aa  608  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  54.17 
 
 		 1164 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  53.32 
 
 		 1106 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  53.39 
 
 		 1137 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  53.39 
 
 		 1137 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  53.04 
 
 		 1099 aa  608  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  53.39 
 
 		 1137 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  53.53 
 
 		 1105 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  52.55 
 
 		 1116 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  54.58 
 
 		 1136 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  52.49 
 
 		 1105 aa  605  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  54.31 
 
 		 1109 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  52.89 
 
 		 1108 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  52.67 
 
 		 1098 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  55.3 
 
 		 1137 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  54.8 
 
 		 1100 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  53.6 
 
 		 1108 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  53.58 
 
 		 1108 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  55.3 
 
 		 1137 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  52.19 
 
 		 1116 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  53.46 
 
 		 1101 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  52.7 
 
 		 1142 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  53.8 
 
 		 1160 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  52.91 
 
 		 1139 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  53.42 
 
 		 1113 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  54.21 
 
 		 1138 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  53.26 
 
 		 1099 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  52.83 
 
 		 1088 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  53.31 
 
 		 1100 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  52.46 
 
 		 1098 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  52.56 
 
 		 1093 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  52.28 
 
 		 1093 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  53.36 
 
 		 1100 aa  599  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  53.92 
 
 		 1110 aa  600  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  53.11 
 
 		 1100 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>