More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6446 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4201  response regulator receiver domain-containing protein  36.18 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4333  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36.18 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4350  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.06 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767241  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4356  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35.77 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3802  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35.89 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0707641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3886  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35.89 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3745  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3737  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00249462  normal  0.888945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6781  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.9 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  35.66 
 
 		 785 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  36.97 
 
 		 785 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 863 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  36.97 
 
 		 785 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  38.98 
 
 		 778 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4589  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.71 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 802 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  34.07 
 
 		 2284 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  31.06 
 
 		 497 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  29.92 
 
 		 1200 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  29.37 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4516  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.28 
 
 		 1137 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.81 
 
 		 853 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 125 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  30.16 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 125 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 921 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  34.07 
 
 		 1060 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 781 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 643 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 859 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 643 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 868 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 916 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 2654 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.62 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 782 aa  69.3  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.88 
 
 		 1499 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  36.13 
 
 		 785 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.77 
 
 		 1233 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  29.23 
 
 		 1236 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1230 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4368  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  28.75 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 782 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 1234 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4345  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  28.75 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0926285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  36.67 
 
 		 896 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 643 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 1245 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 		 2301 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 1236 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 579 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 2037 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  35.56 
 
 		 896 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 896 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 896 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.06 
 
 		 796 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1234 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  35.56 
 
 		 896 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  35.56 
 
 		 896 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0796  response regulator receiver domain-containing protein  29.17 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.952711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4213  response regulator receiver domain-containing protein  28.63 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.871258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  35.56 
 
 		 896 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 1333 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  37.3 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  29.1 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  37.3 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 1310 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 1977 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 865 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 1689 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 390 aa  65.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.65 
 
 		 1053 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 968 aa  65.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1236 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  31.97 
 
 		 458 aa  65.5  0.0000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1236 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.4 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  28.35 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 125 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1917 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 		 902 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1236 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1070 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>