More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4977 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 479 aa  960    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  51.17 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  48.58 
 
 		 468 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  47.04 
 
 		 509 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  47.04 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  46.82 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  45.88 
 
 		 590 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  45.68 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  45.65 
 
 		 517 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  44.04 
 
 		 491 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  45.63 
 
 		 479 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  45.45 
 
 		 466 aa  369  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  44.47 
 
 		 494 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  45.18 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  38.6 
 
 		 444 aa  346  6e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  43.72 
 
 		 488 aa  345  8.999999999999999e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  41.55 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  43.68 
 
 		 449 aa  341  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  41.41 
 
 		 531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  44.97 
 
 		 470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  46.51 
 
 		 444 aa  335  7.999999999999999e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  43.29 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  38.7 
 
 		 456 aa  293  6e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  38.78 
 
 		 451 aa  291  3e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  38.56 
 
 		 451 aa  291  3e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  39.87 
 
 		 451 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  31.53 
 
 		 551 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  30.11 
 
 		 531 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  34.22 
 
 		 652 aa  181  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  32.89 
 
 		 654 aa  172  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  33.07 
 
 		 650 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  33.86 
 
 		 647 aa  163  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  32.35 
 
 		 558 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  34.59 
 
 		 548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  33.58 
 
 		 551 aa  154  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.1 
 
 		 550 aa  150  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  32.47 
 
 		 548 aa  150  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.34 
 
 		 558 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  32.83 
 
 		 557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  32.83 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  32.09 
 
 		 548 aa  147  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  33.08 
 
 		 546 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  31.74 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  31.17 
 
 		 549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  29.97 
 
 		 551 aa  140  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.7 
 
 		 555 aa  139  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  31.1 
 
 		 666 aa  136  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  29.17 
 
 		 602 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  30.4 
 
 		 548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  29.76 
 
 		 545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  30.49 
 
 		 548 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  31.65 
 
 		 649 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  30.19 
 
 		 630 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  25.96 
 
 		 590 aa  128  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  30.93 
 
 		 559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  29.85 
 
 		 545 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.15 
 
 		 548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  29.29 
 
 		 548 aa  126  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  30.67 
 
 		 561 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  30.71 
 
 		 581 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  28.97 
 
 		 554 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  29.5 
 
 		 550 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  26.84 
 
 		 838 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  37.57 
 
 		 630 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  29.15 
 
 		 555 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  28.8 
 
 		 542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  29.72 
 
 		 658 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  28.91 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  28.91 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  28.91 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  29.33 
 
 		 549 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  28.67 
 
 		 866 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  25.58 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  31.12 
 
 		 485 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  28.38 
 
 		 549 aa  113  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  30.79 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  25.41 
 
 		 781 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  28.72 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  28.46 
 
 		 951 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  28.64 
 
 		 720 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  27.34 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 		 479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  30.49 
 
 		 479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  29.59 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25.2 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 		 479 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  25.93 
 
 		 707 aa  106  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  28.81 
 
 		 706 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  24.94 
 
 		 818 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  25.59 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  35.67 
 
 		 455 aa  103  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 489 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  26.18 
 
 		 489 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  25.25 
 
 		 698 aa  99  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  23.68 
 
 		 732 aa  96.7  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  26.46 
 
 		 492 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.21 
 
 		 633 aa  93.6  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  24.56 
 
 		 493 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  25.54 
 
 		 696 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>