More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1776 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1776  competence protein F, putative  100 
 
 
239 aa  459  1e-128  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
242 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  40.99 
 
 
238 aa  140  2e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.66 
 
 
238 aa  139  5e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.02342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  36.97 
 
 
233 aa  128  8e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  37.34 
 
 
243 aa  126  4e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
271 aa  124  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 
270 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  37.67 
 
 
244 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
247 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  33.93 
 
 
234 aa  121  1e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  41.3 
 
 
253 aa  120  1e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
245 aa  121  1e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
217 aa  120  1e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  36.64 
 
 
229 aa  120  2e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  36.86 
 
 
246 aa  120  2e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  39.41 
 
 
267 aa  120  2e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
248 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  33.89 
 
 
245 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.43751e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.96 
 
 
246 aa  118  8e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  33.93 
 
 
234 aa  117  1e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  36.13 
 
 
243 aa  118  1e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 
246 aa  117  2e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  27.31 
 
 
230 aa  116  2e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.21 
 
 
296 aa  117  2e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  37.82 
 
 
237 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  37.26 
 
 
245 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.05 
 
 
243 aa  115  7e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  35.78 
 
 
241 aa  114  1e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  39.39 
 
 
255 aa  114  1e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  35.54 
 
 
258 aa  114  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  35.12 
 
 
258 aa  113  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
244 aa  113  2e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  37.34 
 
 
255 aa  112  4e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  35.78 
 
 
241 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  39.3 
 
 
238 aa  111  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  36.4 
 
 
243 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  39.83 
 
 
246 aa  111  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 
258 aa  111  1e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
255 aa  111  1e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
247 aa  111  1e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  35.19 
 
 
262 aa  110  2e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  31.93 
 
 
227 aa  110  2e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.80305e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
239 aa  109  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
237 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.95242e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
220 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  7.9712e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 
239 aa  108  7e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
271 aa  108  9e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  37.07 
 
 
237 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
239 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  27.73 
 
 
230 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  37.07 
 
 
263 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  35.8 
 
 
262 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  35.02 
 
 
236 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 
254 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  41 
 
 
251 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 
239 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
220 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  39.61 
 
 
242 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.99 
 
 
215 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  31.3 
 
 
231 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  36.87 
 
 
259 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
236 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  38.08 
 
 
262 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  38.49 
 
 
241 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  36.4 
 
 
239 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  37.76 
 
 
255 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  33.61 
 
 
242 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
272 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
242 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  38.56 
 
 
241 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  29.96 
 
 
232 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
243 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  35.59 
 
 
227 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  35.56 
 
 
262 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  34.63 
 
 
247 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.28235e-09  hitchhiker  2.30998e-07 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
258 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  35.59 
 
 
227 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 
279 aa  101  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.54112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  33.48 
 
 
226 aa  101  9e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  35.17 
 
 
227 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  38.36 
 
 
230 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  35.59 
 
 
227 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
223 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  2.98653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 
269 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  35.17 
 
 
227 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  32.27 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  38.43 
 
 
230 aa  99  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  37.61 
 
 
256 aa  99  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  32.41 
 
 
233 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  33.8 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  35.75 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  35.33 
 
 
293 aa  96.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  40.17 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  32.91 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  32.91 
 
 
227 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  32.91 
 
 
227 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>