More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0293 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0293  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 834 aa  1704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  39.95 
 
 		 852 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  37.96 
 
 		 804 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  37.33 
 
 		 852 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  37.56 
 
 		 852 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  37.44 
 
 		 852 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  36.01 
 
 		 829 aa  438  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  36.97 
 
 		 841 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  35.41 
 
 		 827 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  36.01 
 
 		 818 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  35.55 
 
 		 818 aa  429  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  36.06 
 
 		 796 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  35.38 
 
 		 797 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  34.27 
 
 		 795 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  34.68 
 
 		 773 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  33.88 
 
 		 862 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  34.9 
 
 		 802 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  34.99 
 
 		 807 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  35.36 
 
 		 778 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  34.05 
 
 		 812 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  34.42 
 
 		 808 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  34.3 
 
 		 835 aa  392  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  34.47 
 
 		 807 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  34.17 
 
 		 805 aa  389  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  33.58 
 
 		 831 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  32.65 
 
 		 830 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  33.63 
 
 		 805 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  34.01 
 
 		 810 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  34.16 
 
 		 831 aa  379  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  33.89 
 
 		 803 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  33.59 
 
 		 833 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  32.89 
 
 		 804 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  31.74 
 
 		 823 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  33.38 
 
 		 805 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  31.37 
 
 		 823 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  32.91 
 
 		 823 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 		 817 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  33.29 
 
 		 830 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  32.25 
 
 		 819 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  32.53 
 
 		 819 aa  369  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  33.61 
 
 		 908 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  31.17 
 
 		 794 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  31.04 
 
 		 794 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  33.38 
 
 		 804 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  32.38 
 
 		 819 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  32.11 
 
 		 819 aa  365  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  33.29 
 
 		 777 aa  364  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  32.02 
 
 		 843 aa  364  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  33.21 
 
 		 830 aa  363  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  32.41 
 
 		 809 aa  363  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  32.7 
 
 		 792 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  34.47 
 
 		 800 aa  363  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  31.59 
 
 		 817 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  32.53 
 
 		 833 aa  360  5e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  31.53 
 
 		 778 aa  360  7e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  31.99 
 
 		 819 aa  359  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  34.23 
 
 		 791 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  33.58 
 
 		 830 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  31.63 
 
 		 804 aa  357  5e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  33.04 
 
 		 832 aa  357  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  32.27 
 
 		 791 aa  355  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  32.27 
 
 		 804 aa  354  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  33.58 
 
 		 807 aa  354  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  31.44 
 
 		 817 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  31.44 
 
 		 817 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 		 814 aa  353  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  32.44 
 
 		 803 aa  353  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  32.35 
 
 		 777 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  32.35 
 
 		 777 aa  352  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  32.43 
 
 		 794 aa  352  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  32.68 
 
 		 791 aa  351  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 		 797 aa  351  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  31.07 
 
 		 817 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  34.73 
 
 		 773 aa  350  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  32.65 
 
 		 779 aa  350  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  32.4 
 
 		 824 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  30.45 
 
 		 815 aa  349  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 845 aa  348  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 766 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  32.05 
 
 		 805 aa  348  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  34.26 
 
 		 857 aa  348  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  32.22 
 
 		 801 aa  348  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  30.98 
 
 		 778 aa  347  6e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  31.72 
 
 		 818 aa  346  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  30.51 
 
 		 814 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  32.36 
 
 		 802 aa  343  9e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 793 aa  342  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  34.74 
 
 		 803 aa  342  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  33.08 
 
 		 799 aa  342  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  31.79 
 
 		 818 aa  341  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  30.14 
 
 		 839 aa  341  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  32.86 
 
 		 849 aa  340  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  33.25 
 
 		 849 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  31.68 
 
 		 797 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  33.08 
 
 		 849 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  30.14 
 
 		 851 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  30.14 
 
 		 851 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  30.14 
 
 		 851 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.05 
 
 		 748 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  29.46 
 
 		 846 aa  337  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>