More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0183 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
222 aa  231  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
228 aa  228  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  50.71 
 
 
223 aa  211  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  50.47 
 
 
218 aa  208  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
223 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
227 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  48.34 
 
 
218 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  48.83 
 
 
235 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  48.83 
 
 
235 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  48.83 
 
 
235 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  49.29 
 
 
221 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
224 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
222 aa  201  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
224 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
230 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
224 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
224 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
224 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  46.61 
 
 
224 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  47.87 
 
 
218 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  46.92 
 
 
233 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  48.36 
 
 
223 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  46.41 
 
 
221 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  43.4 
 
 
226 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  44.81 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  45.75 
 
 
221 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  44.98 
 
 
226 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  46.23 
 
 
221 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
218 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  41.26 
 
 
234 aa  168  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
189 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  44.81 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  44.63 
 
 
184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
227 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
220 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
222 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  40.93 
 
 
221 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 
221 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  36.18 
 
 
219 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
219 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
253 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
232 aa  143  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 
124 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  49.07 
 
 
124 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  42.34 
 
 
114 aa  99  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  40.28 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  42.5 
 
 
459 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  27.5 
 
 
146 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  27.5 
 
 
124 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
459 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  42.68 
 
 
459 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
459 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  34.86 
 
 
167 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
459 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
172 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
459 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
114 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  36.54 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 
150 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  39.36 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  38.64 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  37.35 
 
 
280 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 
128 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  38.71 
 
 
186 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 
144 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  50.75 
 
 
132 aa  59.3  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  39 
 
 
109 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.02 
 
 
361 aa  58.9  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 
116 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.23 
 
 
182 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
150 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 
470 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  40.32 
 
 
284 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 
480 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  38.03 
 
 
565 aa  58.2  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  34.83 
 
 
110 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  43.75 
 
 
127 aa  58.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
107 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
107 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  36.96 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  31.82 
 
 
132 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
125 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
113 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 
112 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 
124 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.17 
 
 
550 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.19 
 
 
116 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 
98 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  33.64 
 
 
380 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 
113 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 
167 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 
123 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.63 
 
 
136 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 
98 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
108 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  36.04 
 
 
567 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  28.91 
 
 
142 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  52.17 
 
 
131 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>