186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1412 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
321 aa  652  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 
324 aa  162  5e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  23.17 
 
 
289 aa  74.7  2e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.9607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  23.49 
 
 
290 aa  75.1  2e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.3368e-07  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  23.17 
 
 
290 aa  72.8  7e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.19929e-09  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  23.17 
 
 
289 aa  72  1e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.49804e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  23.17 
 
 
289 aa  72  1e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.40538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  23.17 
 
 
289 aa  72  1e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.20218e-09  hitchhiker  1.31905e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  23.17 
 
 
289 aa  72  1e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.67219e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  23.17 
 
 
290 aa  71.6  2e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.91416e-06  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  24.48 
 
 
309 aa  71.2  2e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  24.43 
 
 
289 aa  70.5  4e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.4464e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  24.05 
 
 
292 aa  67.8  2e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  20.42 
 
 
289 aa  64.3  3e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  23.67 
 
 
286 aa  63.2  6e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2800  OmpA/MotB domain-containing protein  48.15 
 
 
177 aa  62.4  9e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.705658  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  21.28 
 
 
291 aa  62  1e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  37.04 
 
 
193 aa  60.8  3e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  7.95687e-05 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  22.73 
 
 
293 aa  60.5  4e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.66037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  27.23 
 
 
321 aa  59.7  7e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  23.15 
 
 
315 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  20.26 
 
 
289 aa  58.2  2e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  22.61 
 
 
289 aa  58.2  2e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.24837e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  19.81 
 
 
287 aa  57  4e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 
544 aa  57  4e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  21.89 
 
 
322 aa  57  5e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  37.18 
 
 
264 aa  56.6  6e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  22.06 
 
 
297 aa  55.5  1e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.46772e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  25.09 
 
 
321 aa  55.5  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3709  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 
183 aa  54.7  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  23.22 
 
 
294 aa  54.7  2e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.08227e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  33.33 
 
 
1313 aa  54.7  2e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
270 aa  53.9  3e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  21.58 
 
 
289 aa  54.3  3e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
270 aa  53.9  4e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  25.68 
 
 
280 aa  53.9  4e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  20.62 
 
 
290 aa  53.5  4e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
270 aa  53.9  4e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 
543 aa  53.5  5e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0354  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 
315 aa  53.1  6e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 
217 aa  52.8  8e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
270 aa  52.8  8e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.5 
 
 
525 aa  52.8  9e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.41 
 
 
542 aa  52  1e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1878  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 
179 aa  51.2  2e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  40.3 
 
 
919 aa  51.2  2e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 
270 aa  51.2  2e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  25.54 
 
 
205 aa  51.6  2e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.5431e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2055  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 
179 aa  51.2  2e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0263919  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.91 
 
 
631 aa  51.6  2e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.39 
 
 
172 aa  50.8  3e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 
383 aa  50.8  3e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 
216 aa  50.8  3e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 
216 aa  50.8  3e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  33.64 
 
 
230 aa  50.1  5e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  24.45 
 
 
301 aa  50.1  5e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  21.97 
 
 
293 aa  49.7  6e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 
576 aa  49.7  7e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.05 
 
 
560 aa  49.7  7e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 
537 aa  49.3  8e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  31.78 
 
 
225 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.77 
 
 
374 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  31.69 
 
 
172 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  23.01 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0357  OmpA/MotB  33.33 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5131  OmpA/MotB domain protein  35.44 
 
 
170 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 
203 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  37.8 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.39 
 
 
510 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  32.08 
 
 
656 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  37.33 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  37.8 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  20.5 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.33 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  37.8 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  37.33 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 
220 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  36.19 
 
 
270 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.17 
 
 
171 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  22.55 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  34.67 
 
 
261 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  35.53 
 
 
201 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  34.67 
 
 
261 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  29.91 
 
 
214 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.18 
 
 
199 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 
166 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  36.59 
 
 
236 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  32.61 
 
 
240 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  36.59 
 
 
223 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  33.02 
 
 
637 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  36.59 
 
 
236 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  36.59 
 
 
236 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
261 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  34.19 
 
 
558 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  32.38 
 
 
842 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 
264 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
729 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  28.85 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  6.45517e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  31.73 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  5.40093e-10  decreased coverage  5.07763e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>