More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3142 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3142  cytidylate kinase  100 
 
 
229 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00253738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0862  cytidylate kinase  51.82 
 
 
232 aa  221  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316636  hitchhiker  0.00695243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0324  cytidylate kinase  49.78 
 
 
244 aa  215  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1668  cytidylate kinase  52.31 
 
 
230 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0688  cytidylate kinase  46.94 
 
 
200 aa  171  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  39.29 
 
 
228 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  41.94 
 
 
221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  40.55 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.95 
 
 
224 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.47 
 
 
526 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  42.13 
 
 
539 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  41.7 
 
 
229 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  40.83 
 
 
225 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.01 
 
 
528 aa  156  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  36.41 
 
 
218 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.19 
 
 
511 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.19 
 
 
511 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  40.81 
 
 
229 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  40.18 
 
 
225 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  39.63 
 
 
230 aa  154  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.86 
 
 
534 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.05 
 
 
232 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  40.18 
 
 
225 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  39.45 
 
 
225 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  39.27 
 
 
225 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  39.27 
 
 
225 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.5 
 
 
516 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  39.27 
 
 
225 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  39.45 
 
 
225 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  39.27 
 
 
225 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  42.15 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.47 
 
 
527 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.05 
 
 
516 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  41.59 
 
 
218 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  38.81 
 
 
225 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  41.04 
 
 
233 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.27 
 
 
480 aa  149  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  39.55 
 
 
222 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  39.63 
 
 
223 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.45 
 
 
529 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.38 
 
 
483 aa  148  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  39.27 
 
 
225 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  39.34 
 
 
233 aa  148  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.94 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  41.12 
 
 
227 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  34.93 
 
 
517 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.33 
 
 
509 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  35.48 
 
 
240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  41.78 
 
 
226 aa  144  9e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  36.87 
 
 
219 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  35.43 
 
 
232 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  39.73 
 
 
252 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  39.01 
 
 
227 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  37.79 
 
 
233 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  38.6 
 
 
230 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  40.64 
 
 
219 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  40.64 
 
 
219 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  38.01 
 
 
224 aa  141  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  37.1 
 
 
219 aa  141  8e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  40.45 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  39.73 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  39.01 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  40.09 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  39.56 
 
 
514 aa  139  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  36.41 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  39.91 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  43.58 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.43 
 
 
488 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  40 
 
 
229 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  38.53 
 
 
215 aa  138  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  37.95 
 
 
232 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  38.89 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  37.38 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  36.12 
 
 
217 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  40.65 
 
 
237 aa  135  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  39.63 
 
 
224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  36.12 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  38.25 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  35.48 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  35.35 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  37.61 
 
 
225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  37.73 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  35.32 
 
 
213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  38.07 
 
 
227 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  35.94 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  38.25 
 
 
219 aa  132  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  35.24 
 
 
230 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  35.24 
 
 
230 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  37.39 
 
 
229 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  36.2 
 
 
232 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  38.07 
 
 
229 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  37.78 
 
 
237 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  40.37 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  37.85 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  37.85 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  42.08 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  42.08 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  38.5 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  36 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  37.16 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>