More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1923 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  100 
 
 
250 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  65.2 
 
 
250 aa  346  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  63.05 
 
 
254 aa  325  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  62.65 
 
 
254 aa  317  9e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  58.87 
 
 
257 aa  292  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  55.02 
 
 
248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  58.63 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  56.05 
 
 
254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  56.45 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 
251 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 
248 aa  278  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 
248 aa  278  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  57.79 
 
 
249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  56.63 
 
 
249 aa  272  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  56.38 
 
 
255 aa  268  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  51.42 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  52.46 
 
 
251 aa  265  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 
251 aa  265  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  54.66 
 
 
256 aa  265  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 
251 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 
251 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 
249 aa  264  8e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 
251 aa  263  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  51.79 
 
 
253 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  51.21 
 
 
250 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 
251 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 
251 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 
252 aa  263  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 
251 aa  262  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  52 
 
 
251 aa  262  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
251 aa  262  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  51.64 
 
 
251 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  51.64 
 
 
251 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  51.64 
 
 
251 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  51.64 
 
 
251 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 
250 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  51 
 
 
251 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
251 aa  259  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
298 aa  259  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  50 
 
 
253 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  51.23 
 
 
251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
253 aa  258  6e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
241 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  54.01 
 
 
243 aa  257  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
253 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
253 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.02 
 
 
654 aa  256  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 
253 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  51 
 
 
241 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  53.41 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  51.78 
 
 
265 aa  251  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 
250 aa  251  7e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 
253 aa  251  7e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 
248 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
263 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  51.9 
 
 
243 aa  249  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 
253 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  51.76 
 
 
261 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  53.85 
 
 
248 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 
250 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  56.92 
 
 
263 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  51 
 
 
241 aa  248  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 
253 aa  247  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  54.4 
 
 
253 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  52.78 
 
 
260 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  52.96 
 
 
258 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 
253 aa  246  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
251 aa  246  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 
257 aa  246  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  49.19 
 
 
251 aa  246  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 
257 aa  246  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  50.81 
 
 
251 aa  245  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 
246 aa  245  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
252 aa  245  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.17 
 
 
687 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  56.45 
 
 
253 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  56.45 
 
 
253 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  51.63 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  50 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  50.83 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.39 
 
 
650 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  50.83 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.57 
 
 
655 aa  242  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  52.85 
 
 
245 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  53.57 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  51.37 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  52.78 
 
 
263 aa  241  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
250 aa  241  9e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  48.22 
 
 
248 aa  240  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 
260 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
252 aa  240  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  50.98 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 
243 aa  238  5e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  51.19 
 
 
261 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>