More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3618 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 362 aa  746    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  56.92 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  55.76 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  54.49 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  57.42 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  45.54 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  54.74 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  39.25 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  37.14 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  40.89 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  37.34 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  35.09 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  36.25 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  37.72 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  35.06 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  35.82 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.9 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  34.26 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  35.27 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  35.27 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  36.21 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  35.65 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  35.62 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.48 
 
 		 343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  34.48 
 
 		 324 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  34.93 
 
 		 358 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  34.91 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  38.97 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  30.86 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  34.64 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  38.6 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  32.56 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  35.81 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  34.13 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  34.25 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  32.28 
 
 		 356 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  34.55 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  34.58 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 403 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  35.23 
 
 		 328 aa  176  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  33.66 
 
 		 442 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  31.5 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.99 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  35.47 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  34.38 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  30.84 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  33 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.99 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  32.77 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  31.4 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  32.2 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  31.7 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  33.84 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  33.86 
 
 		 620 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  31.01 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  33.12 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  36.53 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  35.62 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  34.97 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  31.7 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.67 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.7 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  37.29 
 
 		 492 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  36.4 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  33 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 399 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  33.56 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  32.44 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  33.56 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  35.15 
 
 		 412 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 393 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  32.44 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  32.44 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  33 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  33.79 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  33.79 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  34.46 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  31.7 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  31.7 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  38.89 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  31.85 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  33.45 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  33.66 
 
 		 325 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  34.94 
 
 		 345 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  38.81 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  32.88 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>