155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2286 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  100 
 
 		 156 aa  318  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  47.1 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  46.85 
 
 		 156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.58 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.23 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  40.52 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.28 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.88 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.89 
 
 		 169 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  39.1 
 
 		 164 aa  97.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  32.48 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.81 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.08 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.64 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  33.55 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  34.62 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  34 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.89 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  34 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  34 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  34 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  34 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  25.79 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  33.33 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  33.56 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  33.33 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.41 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  28.49 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  33.33 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  33.33 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  35.11 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.14 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  32 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.59 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  30 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  33.58 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  33.58 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  31.61 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.56 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  30.82 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  33.83 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.94 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.17 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  29.17 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  30.46 
 
 		 177 aa  63.5  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  28.49 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.55 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  29.38 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  30.65 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  28.48 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  28.48 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.54 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  29.41 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  32.08 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  32.08 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.38 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  28.92 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  28.49 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.38 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  29.21 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  26.88 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  29.75 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  30.47 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.49 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.49 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  26.54 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.56 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  27.06 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.07 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  26 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 186 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  29.27 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  30.22 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  23.83 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  25.64 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.54 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  23.36 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.27 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  26.23 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  25.83 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  25.9 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  30.19 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  28.39 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  26.28 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  28.39 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  28.39 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>