153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4475 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 220 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  57.92 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  61.71 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.27 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.27 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.27 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.45 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  58.85 
 
 		 220 aa  187  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.34 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.8 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.93 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.49 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  52.73 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.92 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.35 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  43.46 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.66 
 
 		 223 aa  138  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.73 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  56.76 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.82 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.95 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.39 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  41.28 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  40.18 
 
 		 218 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.19 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.98 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.27 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.27 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.27 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  40.27 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  37.44 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  38.43 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  38.6 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  38.46 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  41.31 
 
 		 374 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  39.49 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  32 
 
 		 280 aa  92.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  28.05 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.18 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  27.15 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  27.15 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  27.4 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  30.09 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  35.81 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  26.81 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.96 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  28.96 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  28.96 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  29.86 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.58 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  29.15 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.25 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  29.09 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  30.36 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  25.43 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.62 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  25.68 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  28.08 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  26.19 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  27.71 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  31.19 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  31.68 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  30.87 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  31.96 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  27.04 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0028  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.1 
 
 		 330 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 		 297 aa  52  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.78 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.03 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  31.67 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  31.76 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  28.8 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 310 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>