More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2648 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 306 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  50 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  44.95 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  49.33 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  47.24 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 288 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  44.85 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  45.86 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  43.19 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  34 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  44.72 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  40.73 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  41.45 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  41.22 
 
 		 300 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  38.15 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  36.98 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  38.21 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 304 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  37.82 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  35.93 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  38.37 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 		 350 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  35.47 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  38.55 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  34.33 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  37.15 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  26.21 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  27.67 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>