More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2260 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
466 aa  945    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  46.48 
 
 
459 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  42.49 
 
 
479 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  41.21 
 
 
461 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  44.52 
 
 
469 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  42.08 
 
 
461 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.27 
 
 
472 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.21 
 
 
464 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  42.14 
 
 
473 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.56 
 
 
465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  41.28 
 
 
474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.09 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  39.83 
 
 
479 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  42.51 
 
 
499 aa  323  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  44.83 
 
 
465 aa  322  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  39.51 
 
 
479 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  43.4 
 
 
476 aa  319  6e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.05 
 
 
479 aa  319  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  40.91 
 
 
463 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.4 
 
 
461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  43.17 
 
 
461 aa  312  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  44.86 
 
 
460 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  39.51 
 
 
458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  41.02 
 
 
468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  43.6 
 
 
456 aa  303  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  43.83 
 
 
465 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  41.96 
 
 
477 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  42.73 
 
 
456 aa  299  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  42.67 
 
 
477 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  41.96 
 
 
456 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  40.13 
 
 
462 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  41.27 
 
 
465 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  38.84 
 
 
462 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  38.62 
 
 
473 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.39 
 
 
473 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  39.47 
 
 
470 aa  280  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  38.61 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.78 
 
 
444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  41.67 
 
 
461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  39.52 
 
 
602 aa  273  7e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 
465 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  38.01 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  40.34 
 
 
465 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  39.14 
 
 
466 aa  256  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.25 
 
 
478 aa  256  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.25 
 
 
448 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  36.56 
 
 
461 aa  229  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.21 
 
 
469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.29 
 
 
472 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  32.76 
 
 
462 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.89 
 
 
481 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  33.05 
 
 
446 aa  173  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  28.7 
 
 
448 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  33.26 
 
 
473 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  37.37 
 
 
458 aa  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.79 
 
 
436 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  32.39 
 
 
467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 
474 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.76 
 
 
466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  31.87 
 
 
449 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.24 
 
 
484 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  30.62 
 
 
752 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.53 
 
 
705 aa  156  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  27.73 
 
 
444 aa  156  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  27.23 
 
 
444 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 
492 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  30.8 
 
 
448 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.17 
 
 
490 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  34.73 
 
 
450 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.56 
 
 
460 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.52 
 
 
449 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 
447 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 
474 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.07 
 
 
753 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.13 
 
 
462 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.03 
 
 
462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  35.86 
 
 
459 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  40.25 
 
 
487 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  24.95 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.33 
 
 
462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  34.33 
 
 
462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3765  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.05 
 
 
495 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378557  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.71 
 
 
734 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.67 
 
 
462 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  40.64 
 
 
472 aa  136  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  31.46 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.98 
 
 
726 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.71 
 
 
471 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  32.02 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  39.9 
 
 
454 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 
445 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  29.74 
 
 
545 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 
495 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  37 
 
 
764 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
754 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
468 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.95 
 
 
448 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.5 
 
 
473 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  36.32 
 
 
439 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 
507 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>