More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2042 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  62.63 
 
 		 708 aa  837    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  63.98 
 
 		 684 aa  813    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  64.61 
 
 		 703 aa  820    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  70 
 
 		 678 aa  888    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  66.46 
 
 		 663 aa  831    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  72.29 
 
 		 658 aa  925    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  58.53 
 
 		 674 aa  764    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  68.98 
 
 		 660 aa  896    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  68.45 
 
 		 649 aa  857    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  64.88 
 
 		 656 aa  839    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  66.41 
 
 		 670 aa  842    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  63.78 
 
 		 693 aa  843    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  59 
 
 		 647 aa  753    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  69.93 
 
 		 692 aa  918    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  67.54 
 
 		 705 aa  897    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  68.35 
 
 		 665 aa  892    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  68.5 
 
 		 676 aa  896    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  66.38 
 
 		 704 aa  834    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  68.41 
 
 		 646 aa  862    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  69.64 
 
 		 679 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  68.46 
 
 		 644 aa  832    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  68.5 
 
 		 676 aa  897    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  63.17 
 
 		 675 aa  807    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 690 aa  1392    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  72.01 
 
 		 649 aa  914    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  68.91 
 
 		 671 aa  911    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  61 
 
 		 643 aa  748    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  60.1 
 
 		 650 aa  726    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  63.93 
 
 		 659 aa  805    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  68.64 
 
 		 678 aa  889    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  59.77 
 
 		 669 aa  765    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  63.71 
 
 		 641 aa  792    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  68.18 
 
 		 666 aa  865    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  66.62 
 
 		 675 aa  867    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  68.5 
 
 		 676 aa  897    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  62.24 
 
 		 651 aa  726    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  42.82 
 
 		 780 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  44.13 
 
 		 624 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40.48 
 
 		 607 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  45.7 
 
 		 746 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  43.2 
 
 		 620 aa  451  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  41.16 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 620 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  38.35 
 
 		 607 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.57 
 
 		 588 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  42.07 
 
 		 611 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  38.51 
 
 		 607 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.38 
 
 		 641 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  39.63 
 
 		 653 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.04 
 
 		 685 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 625 aa  439  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  41.07 
 
 		 647 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  43.75 
 
 		 622 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  38.29 
 
 		 644 aa  426  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.49 
 
 		 601 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.66 
 
 		 613 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  42.17 
 
 		 607 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  39.16 
 
 		 624 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  36.13 
 
 		 669 aa  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  36.78 
 
 		 615 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.31 
 
 		 619 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 617 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.03 
 
 		 604 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  41.85 
 
 		 614 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 610 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  36.46 
 
 		 665 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  41.04 
 
 		 609 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 		 598 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  36.52 
 
 		 666 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  35.74 
 
 		 613 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 627 aa  412  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  38.82 
 
 		 613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 		 599 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  37.04 
 
 		 682 aa  405  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  36 
 
 		 737 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  39.33 
 
 		 623 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  36.49 
 
 		 616 aa  401  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  39.33 
 
 		 623 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  39.72 
 
 		 612 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  39.01 
 
 		 614 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  36.72 
 
 		 649 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 		 638 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  37.58 
 
 		 677 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 627 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 628 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 629 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.77 
 
 		 631 aa  399  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 		 623 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 		 617 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  38.88 
 
 		 631 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  37.27 
 
 		 643 aa  395  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 		 617 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  37.59 
 
 		 707 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 		 591 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  38.22 
 
 		 623 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  39.18 
 
 		 613 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  33.95 
 
 		 640 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  37.03 
 
 		 636 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>