153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0299 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0299  HPP  100 
 
 		 175 aa  343  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  65.52 
 
 		 174 aa  227  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  70.12 
 
 		 164 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  58.52 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  58.76 
 
 		 188 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  58.76 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  55.68 
 
 		 188 aa  180  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  42.16 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  44.89 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  43.26 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  40.96 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  39.63 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  39.63 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  39.02 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  46.63 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  43.93 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  39.02 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  38.41 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  38.41 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  38.41 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  38.41 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  43.12 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  44.07 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  39.56 
 
 		 199 aa  107  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  42.37 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  42.37 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  41.75 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  39.52 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  41.81 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  41.81 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  41.81 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  41.28 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  42.37 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  42.37 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  47.15 
 
 		 190 aa  103  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  41.01 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  42.37 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  48.39 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  39.02 
 
 		 231 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  36.75 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  39.88 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  35.39 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  43.09 
 
 		 153 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  43.9 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  42.42 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  33.55 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  38.51 
 
 		 325 aa  91.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  42.86 
 
 		 178 aa  91.3  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  42.41 
 
 		 185 aa  90.9  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  40.24 
 
 		 175 aa  90.9  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  32.89 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  33.77 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  42.74 
 
 		 323 aa  89  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  32.89 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  39.39 
 
 		 207 aa  89  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  37.7 
 
 		 159 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  37.7 
 
 		 159 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  36.31 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  38.89 
 
 		 202 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  42.5 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  37.5 
 
 		 286 aa  81.6  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02209  HPP family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07010)  32.57 
 
 		 307 aa  81.3  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.21118  normal  0.252152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  35.9 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  42.72 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  40.35 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  40.16 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  41.03 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  41.6 
 
 		 368 aa  74.7  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  34.17 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  41.8 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  40.14 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  40.14 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  40.34 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  36.94 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  29.61 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  44.35 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  39.17 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  39.5 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  33.82 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  32.89 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  39.69 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 		 390 aa  68.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  36.59 
 
 		 391 aa  68.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 394 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 		 399 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 		 391 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  37.42 
 
 		 400 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  36.88 
 
 		 389 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  43.44 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 		 389 aa  67.8  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 392 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  38.24 
 
 		 373 aa  67.4  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  38.71 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  29.73 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  38.71 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  38.71 
 
 		 465 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>