158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0031 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3342  hypothetical protein  82.59 
 
 		 447 aa  669    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  904    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4309  hypothetical protein  73.67 
 
 		 455 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0254  hypothetical protein  61.79 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0238  hypothetical protein  61.27 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.782841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1719  hypothetical protein  60.19 
 
 		 465 aa  428  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2209  hypothetical protein  30.99 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3528  hypothetical protein  30.72 
 
 		 369 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0572559  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  30.24 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  31.54 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4654  protein of unknown function DUF444  29.79 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2730  hypothetical protein  30.94 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2636  hypothetical protein  30.94 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  29.55 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  28.96 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  29.06 
 
 		 381 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  27.3 
 
 		 376 aa  97.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  28.75 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2990  protein of unknown function DUF444  29.1 
 
 		 368 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2538  hypothetical protein  29.05 
 
 		 368 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  27.37 
 
 		 394 aa  90.9  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  25.83 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1820  protein of unknown function DUF444  28.44 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  25.87 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  26.71 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0606  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0519  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0462  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0458  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0552  hypothetical protein  24.74 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241038 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0551  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0626  hypothetical protein  24.74 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  31.29 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  30.67 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0461  hypothetical protein  26.8 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.360542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  30.67 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  30.67 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4751  hypothetical protein  24.68 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000719469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0466  hypothetical protein  24.68 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  33.61 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  26.3 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0509  hypothetical protein  24.68 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000608063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0587  hypothetical protein  24.37 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0473  hypothetical protein  24.83 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  29.63 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  29.63 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  27.67 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  29.61 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  29.61 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  27.67 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1373  hypothetical protein  24.04 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  28.3 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  31.21 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2705  hypothetical protein  29.3 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139831  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  26.73 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  22.74 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  31.91 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  29.08 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1570  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194924  normal  0.404003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1645  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00220119  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1685  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000901028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  27.03 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  23 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  22.96 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1637  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171589  normal  0.194153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  23 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  26.42 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  26.42 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1780  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000829962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  30.66 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1773  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  28.3 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2335  hypothetical protein  29.03 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.617679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1817  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2060  hypothetical protein  29.03 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.107647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  25.66 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2505  hypothetical protein  29.38 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420079  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  27.67 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  26.99 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  29.6 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  27.39 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  28.57 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  30.25 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  29.6 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  26.83 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  29.6 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  27.67 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  27.67 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  29.6 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2021  hypothetical protein  29.03 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1690  hypothetical protein  27.44 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  27.44 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  27.44 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  27.44 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0815  hypothetical protein  27.44 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0982154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  27.67 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  27.67 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  26.83 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  27.67 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  27.67 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>