More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3725 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 		 227 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.45 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.49 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.19 
 
 		 230 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.98 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.59 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.93 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2066  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.12 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  29.79 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.93 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  27.51 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  26.76 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  27.36 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.26 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.26 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  29.26 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.73 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  25.58 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  28.72 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  26.19 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.54 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  28.72 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  25.59 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  27.44 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  30.85 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  28.19 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.49 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.55 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.87 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  28.19 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  23.04 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  22.48 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.28 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25.26 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>