More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2686 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 182 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  69.41 
 
 		 173 aa  249  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  42.5 
 
 		 163 aa  134  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  38.79 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  32.41 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 271 aa  72  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  29.14 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  29.89 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.31 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.31 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  29.31 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.31 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  29.31 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.31 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  29.31 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  31.18 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 286 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  29.28 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  34.9 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  29.19 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  34.36 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  31.74 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 298 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  29.3 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  30.94 
 
 		 269 aa  60.8  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  30 
 
 		 269 aa  60.8  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  28.57 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  27.53 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  26 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  36.17 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  25.28 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  26.51 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  26.39 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  25.28 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  27.43 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  26.7 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  26.86 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  27.43 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  25.9 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  25.45 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  25.45 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  29.8 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  31.71 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  29.93 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  26.35 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  29.93 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  31.97 
 
 		 283 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  30 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  24.71 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>