More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3501 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 
374 aa  739    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.34 
 
 
380 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  52.42 
 
 
370 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.46 
 
 
370 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.08 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.65 
 
 
370 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.94 
 
 
369 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.22 
 
 
371 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.52 
 
 
368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 
371 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 
371 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.95 
 
 
370 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.14 
 
 
370 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.52 
 
 
368 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.79 
 
 
368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.53 
 
 
367 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.59 
 
 
371 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.45 
 
 
370 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.78 
 
 
371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.78 
 
 
371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.49 
 
 
372 aa  310  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.24 
 
 
372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.51 
 
 
371 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.46 
 
 
389 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.23 
 
 
440 aa  143  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.45 
 
 
443 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.49 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1572  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0317  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  53.61 
 
 
99 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137506  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 
287 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.78 
 
 
437 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
288 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  47.79 
 
 
450 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
309 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
296 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
277 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
312 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.66 
 
 
312 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
290 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
279 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
290 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  47.19 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
270 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  33.7 
 
 
278 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
295 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
285 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
271 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
299 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
283 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
283 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
277 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28 
 
 
291 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
274 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
272 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
315 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  32.04 
 
 
270 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
291 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
276 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 
301 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
273 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
271 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.08 
 
 
315 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  30.04 
 
 
293 aa  87  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.08 
 
 
315 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
277 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3560  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  47.57 
 
 
480 aa  86.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000824091  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
270 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
290 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 
284 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  30.07 
 
 
281 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.87 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  28.87 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.87 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.87 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.87 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.87 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>