More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2445 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  37.89 
 
 		 1132 aa  734    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  60.18 
 
 		 1214 aa  1407    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  48.66 
 
 		 1168 aa  1024    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  66.81 
 
 		 1167 aa  1555    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.64 
 
 		 1132 aa  748    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  71.83 
 
 		 1195 aa  1663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  46.96 
 
 		 1176 aa  1051    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  67.09 
 
 		 1171 aa  1560    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  47.42 
 
 		 1191 aa  1078    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.14 
 
 		 1132 aa  740    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.31 
 
 		 1133 aa  741    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.31 
 
 		 1133 aa  744    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  40.23 
 
 		 1196 aa  804    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  42.25 
 
 		 1150 aa  786    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  65.03 
 
 		 1158 aa  1532    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  43.95 
 
 		 1182 aa  1004    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  41.08 
 
 		 1156 aa  861    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  47.01 
 
 		 1178 aa  1040    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  65.23 
 
 		 1157 aa  1552    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  64.81 
 
 		 1154 aa  1536    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  48.79 
 
 		 1183 aa  1101    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  40.26 
 
 		 1208 aa  816    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  42.33 
 
 		 1150 aa  786    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  65.71 
 
 		 1156 aa  1544    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  45.73 
 
 		 1208 aa  997    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  47.01 
 
 		 1208 aa  1027    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  41.72 
 
 		 1149 aa  768    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.14 
 
 		 1132 aa  740    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.65 
 
 		 1163 aa  847    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  43.19 
 
 		 1188 aa  996    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  47.55 
 
 		 1190 aa  1034    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  47.93 
 
 		 1182 aa  1001    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  47.21 
 
 		 1212 aa  1048    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  42.5 
 
 		 1150 aa  809    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  38.17 
 
 		 1132 aa  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  43.7 
 
 		 1182 aa  1000    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  38.47 
 
 		 1169 aa  743    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  40.28 
 
 		 1189 aa  809    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  43.67 
 
 		 1188 aa  994    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.22 
 
 		 1132 aa  741    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  38.31 
 
 		 1132 aa  746    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.47 
 
 		 1132 aa  747    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  62.34 
 
 		 1193 aa  1433    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  47.62 
 
 		 1215 aa  1025    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  43.47 
 
 		 1191 aa  978    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  47.33 
 
 		 1171 aa  991    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  38.66 
 
 		 1136 aa  733    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  63.26 
 
 		 1176 aa  1466    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  65.34 
 
 		 1154 aa  1570    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  43.27 
 
 		 1188 aa  991    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  46.59 
 
 		 1197 aa  1047    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  46.43 
 
 		 1224 aa  1039    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  47.66 
 
 		 1223 aa  1033    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  64.86 
 
 		 1169 aa  1535    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  72.84 
 
 		 1178 aa  1762    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  62.3 
 
 		 1181 aa  1449    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  50.46 
 
 		 1151 aa  1073    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  60.24 
 
 		 1216 aa  1411    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  47.29 
 
 		 1191 aa  1077    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  63.28 
 
 		 1158 aa  1462    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  65.12 
 
 		 1173 aa  1535    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  38.15 
 
 		 1136 aa  721    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  38.72 
 
 		 1180 aa  791    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  100 
 
 		 1199 aa  2446    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  69.87 
 
 		 1184 aa  1696    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  45.25 
 
 		 1214 aa  1002    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.47 
 
 		 1132 aa  754    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  43.12 
 
 		 1187 aa  991    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  79.51 
 
 		 1192 aa  1934    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  39.6 
 
 		 1254 aa  797    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  35.08 
 
 		 1226 aa  590  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  33.01 
 
 		 1266 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  35.45 
 
 		 1236 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  33.06 
 
 		 1239 aa  581  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  32.69 
 
 		 1233 aa  582  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  33.55 
 
 		 1250 aa  579  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  34.35 
 
 		 1250 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  35.14 
 
 		 1247 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  34.35 
 
 		 1250 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  34.52 
 
 		 1250 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.74 
 
 		 1226 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  33.6 
 
 		 1237 aa  571  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  35.1 
 
 		 1250 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  34.83 
 
 		 1245 aa  572  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  32.19 
 
 		 1226 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  34.55 
 
 		 1243 aa  569  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  33.47 
 
 		 1267 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0197  B12-dependent methionine synthase  33.68 
 
 		 1263 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  33.71 
 
 		 1232 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  34.46 
 
 		 1248 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  34.37 
 
 		 1257 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  31.97 
 
 		 1226 aa  562  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  34.3 
 
 		 1257 aa  562  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  33.55 
 
 		 1271 aa  561  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  34.32 
 
 		 1264 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  32.77 
 
 		 1245 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  34.32 
 
 		 1264 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  32.85 
 
 		 1237 aa  559  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  32.99 
 
 		 1245 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  32.93 
 
 		 1228 aa  556  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>