More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3080 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  91.29 
 
 		 241 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  52.81 
 
 		 247 aa  234  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  45.08 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  39.11 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  40.51 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  40.98 
 
 		 285 aa  165  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  53.39 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  47.55 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  52.54 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  50.43 
 
 		 369 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  49.61 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  49.61 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  49.57 
 
 		 319 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  50 
 
 		 313 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  50 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  47.73 
 
 		 318 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  52.03 
 
 		 184 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  48.7 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  51.89 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  45.69 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  50.46 
 
 		 541 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  50.93 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  50 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  49.56 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  42.47 
 
 		 388 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.97 
 
 		 321 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  47.66 
 
 		 391 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  41.3 
 
 		 223 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  46.88 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  40.94 
 
 		 430 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  41.41 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  48.31 
 
 		 394 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  46.09 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  49.54 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  47.9 
 
 		 605 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  47.15 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  45.45 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  48.15 
 
 		 610 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  40.74 
 
 		 351 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  44.26 
 
 		 377 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  48.18 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  50.88 
 
 		 582 aa  105  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  46.02 
 
 		 315 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  50 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.8 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  45.54 
 
 		 411 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.16 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  44.19 
 
 		 419 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  46.77 
 
 		 332 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.67 
 
 		 751 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  45.83 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  46.96 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  49.56 
 
 		 590 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  43.22 
 
 		 440 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  46.03 
 
 		 414 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.38 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  40.91 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  45.95 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  49.11 
 
 		 468 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  38.4 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  42.28 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.25 
 
 		 375 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  38.27 
 
 		 348 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  42.74 
 
 		 439 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  44.04 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  37.16 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  45.37 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  46.9 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  47.79 
 
 		 727 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  47.79 
 
 		 727 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  48.15 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  42.62 
 
 		 375 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  44.44 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0307  Peptidase M23  38.37 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000988851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  42.99 
 
 		 446 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  44.07 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  43.41 
 
 		 455 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  43.41 
 
 		 456 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  48.18 
 
 		 415 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  47.86 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  45.37 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  44.74 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  40.15 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  44.83 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  49.06 
 
 		 194 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  40.91 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  51.26 
 
 		 374 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  45.19 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  37.35 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  43.36 
 
 		 417 aa  99.4  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  37.66 
 
 		 517 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  46.67 
 
 		 367 aa  99.4  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  46.36 
 
 		 399 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44.19 
 
 		 453 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  45.38 
 
 		 442 aa  98.6  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  45.74 
 
 		 550 aa  98.6  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  43.44 
 
 		 299 aa  98.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  37.35 
 
 		 198 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  43.1 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>