More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0075 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  91.15 
 
 		 226 aa  430  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  40 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1407  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36.05 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000138709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2803  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36.09 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.67 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  35.07 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3220  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.975965  hitchhiker  0.00188513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  37 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36.12 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3263  response regulator  33.8 
 
 		 231 aa  147  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.89 
 
 		 1053 aa  95.1  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.11 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 124 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 121 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  34.17 
 
 		 121 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  40.2 
 
 		 123 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.29 
 
 		 2336 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 123 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 123 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  36.54 
 
 		 2301 aa  89  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  34.51 
 
 		 2301 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  33.33 
 
 		 121 aa  88.2  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1193 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1193 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 124 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 121 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  35 
 
 		 121 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 		 122 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  37.8 
 
 		 647 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  30.51 
 
 		 2476 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  33.64 
 
 		 1987 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 130 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 130 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  30.51 
 
 		 2458 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  44.12 
 
 		 1765 aa  85.5  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  40.95 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1767 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 		 1767 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  33.94 
 
 		 132 aa  85.5  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  33.63 
 
 		 2284 aa  85.1  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  35.85 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 132 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 2414 aa  85.1  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 1907 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 130 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 123 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.73 
 
 		 1992 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1767 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 		 121 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 1832 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 123 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 2212 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.75 
 
 		 1331 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 		 1771 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0467  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117091  normal  0.827791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 1784 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 452 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 1792 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 1782 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 1786 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  32.17 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1013 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4279  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.83 
 
 		 858 aa  82.4  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 1725 aa  82  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 1725 aa  82  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  30.95 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  30.95 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 1274 aa  82  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 782 aa  82  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 376 aa  82  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 2539 aa  81.6  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 2423 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.93 
 
 		 1960 aa  81.6  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  32.48 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 452 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 133 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  34.75 
 
 		 160 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 126 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.82 
 
 		 1971 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 133 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>