More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4023 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  90.77 
 
 		 260 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  53.73 
 
 		 251 aa  235  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  51.72 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  52.91 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  57.14 
 
 		 196 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  53.52 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  64.41 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  58.82 
 
 		 196 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  54.33 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  43.5 
 
 		 207 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  59.29 
 
 		 174 aa  136  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  53.66 
 
 		 235 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  50.82 
 
 		 217 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  42.61 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  52.46 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  51.59 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  50.36 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  51.24 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  54.31 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  51.26 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  47.01 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  51.33 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  51.33 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  48.89 
 
 		 146 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  46.97 
 
 		 189 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  49.58 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  44.12 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  52.17 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  46.04 
 
 		 442 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  54.46 
 
 		 438 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  51.61 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  51.26 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  50.42 
 
 		 217 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  45.59 
 
 		 328 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  49.18 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  50 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  45.08 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  45.08 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  52.1 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  46.22 
 
 		 202 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.68 
 
 		 217 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.06 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  44.63 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  43.8 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  43.8 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  43.8 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  47.86 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  43.8 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  44.22 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  45.3 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  47.83 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  47.86 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  47.86 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  41.84 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  43.8 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  44.7 
 
 		 198 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  48.41 
 
 		 202 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  51.33 
 
 		 208 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 		 245 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  35.43 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  45.83 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  42.98 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  46.22 
 
 		 203 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  46.92 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  48.31 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  47.11 
 
 		 327 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  45.22 
 
 		 1160 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  47.32 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  48.21 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  46.49 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  47.11 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  46.72 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  48.67 
 
 		 197 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  48.67 
 
 		 218 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  46.9 
 
 		 175 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  48.25 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  49.57 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0555  lytic transglycosylase, catalytic  45.13 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  41.04 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  41.04 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  44.17 
 
 		 669 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  46.9 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  46.62 
 
 		 603 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  46.55 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  46.9 
 
 		 224 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  50.85 
 
 		 278 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>