More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3816 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 379 aa  778    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  41.53 
 
 		 623 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 357 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1536  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.248937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 452 aa  79.3  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 624 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  24.7 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  27.42 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  29.96 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.36 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.36 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.34 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 679 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 		 616 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  30.96 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.47 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 899 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 995 aa  68.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  27.97 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  31.2 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.89 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0659  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  23.77 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.31 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 355 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  28.64 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  26.56 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  27.52 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  29.21 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  33.33 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  23.4 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  31.62 
 
 		 1219 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  32.24 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  27.47 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  28.52 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  21.93 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>