More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3213 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  93.36 
 
 
256 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  57.81 
 
 
273 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  49.12 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  47.62 
 
 
289 aa  201  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  44.26 
 
 
253 aa  198  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  44.26 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  44.83 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  40.23 
 
 
272 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  41.7 
 
 
262 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  46.96 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  44.63 
 
 
276 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  44.08 
 
 
276 aa  174  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  41.87 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 
320 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 
243 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 
238 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  39.74 
 
 
380 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.5 
 
 
780 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  40.09 
 
 
267 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  32.78 
 
 
325 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  37.56 
 
 
441 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
267 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
237 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
236 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  36.91 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 
606 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  31.28 
 
 
574 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  32.62 
 
 
435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
496 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
237 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
613 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  30.97 
 
 
348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
411 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
422 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
424 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
230 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
266 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
238 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
230 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
415 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
437 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
460 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  31.49 
 
 
425 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  30.9 
 
 
238 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
409 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  33.02 
 
 
428 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
410 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 
416 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  32.08 
 
 
402 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
412 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
235 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 
250 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
337 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
421 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
421 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
421 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
326 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  32.7 
 
 
332 aa  99.4  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3541  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.62234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  29.19 
 
 
405 aa  95.9  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
323 aa  95.5  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  31.28 
 
 
389 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
227 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  29.91 
 
 
328 aa  93.6  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
227 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34317  dolichol phosphate glucosyltransferase  30.24 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
325 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0092  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0975573  normal  0.193732 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4190  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
294 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5177  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.03 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
314 aa  89  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3836  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
254 aa  89  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  29.79 
 
 
298 aa  89  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
432 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
278 aa  88.6  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
234 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
227 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
331 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2953  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
244 aa  86.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549446  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
336 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>