More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2953 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2953  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 244 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3541  glycosyl transferase family 2  43.51 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.62234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0092  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0975573  normal  0.193732 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  32.34 
 
 		 325 aa  92.4  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  31.74 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 320 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  31.85 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 		 380 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.49 
 
 		 780 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 568 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  32.12 
 
 		 389 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  28.38 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  26.34 
 
 		 574 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0276  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.59 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.50271  decreased coverage  0.0000266916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 568 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  28.64 
 
 		 348 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  32.23 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  32.23 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  32.23 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  32.23 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  32.23 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  32.23 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  29.56 
 
 		 563 aa  66.2  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  28.89 
 
 		 428 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  28 
 
 		 425 aa  65.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.82 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.89 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  28.41 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  28.36 
 
 		 575 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  27.75 
 
 		 568 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1816  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.61786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 		 284 aa  62  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 320 aa  62  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 421 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.36 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.5 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  27.86 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.37 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  27.62 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  26.37 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  26.76 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  27.68 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1941  Ribonuclease III  32.85 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34317  dolichol phosphate glucosyltransferase  26.09 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2760  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  22.5 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  33 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1295  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4836  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000403923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1016  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.902573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>