More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4190 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4190  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
294 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8170  glycosyl transferase family 2  73.03 
 
 
250 aa  361  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5581  glycosyl transferase family 2  68.38 
 
 
256 aa  355  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148994  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2994  glycosyl transferase family protein  68.83 
 
 
256 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.54974  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07281  hypothetical protein  31 
 
 
252 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.288535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
586 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3351  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
434 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0805099  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
432 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5177  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
256 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3836  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
254 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1295  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
269 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2869  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
272 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0562178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.05 
 
 
252 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
227 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.45 
 
 
265 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
251 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
246 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.45 
 
 
265 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.45 
 
 
265 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.24 
 
 
246 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.96 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
230 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1363  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.316632  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.11 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  29.82 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.37 
 
 
809 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1303  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3991  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1320  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1339  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193508  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.28 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.46 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.69 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.97 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15970  glycosyl transferase  30.73 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.03 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.41 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.62 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2704  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.02 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2805  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2624  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.56 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.39 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  29.09 
 
 
874 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2710  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.05 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
231 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2405  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  28.3 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  28.57 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3418  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.22 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187526  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0864  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.49 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.04 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3413  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
386 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.86 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1604  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.72 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.05 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0825  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1831  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.298246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.5 
 
 
780 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29.19 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  29.81 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32856  predicted protein  31 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.84 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.03 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  25.91 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.87 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  28.88 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.78 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  28.78 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>