87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2220 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  91.37 
 
 		 196 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  48.39 
 
 		 188 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  46.56 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  41.03 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  47.12 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  43.78 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  37.06 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  32.26 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  34.9 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  48.63 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  34.48 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  30.46 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  34.59 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  38.12 
 
 		 238 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  38.12 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  37.57 
 
 		 250 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  39.13 
 
 		 240 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  37.65 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  35.2 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  34.1 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  35.75 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  29.17 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  33.81 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  34.55 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  32.28 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  31.29 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  28.95 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  34.12 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  34.12 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  27.75 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  35.06 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  33.53 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  29.13 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  33.89 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  29.93 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  34.18 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  22.22 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  26.03 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  26.15 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  26.88 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  29.83 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  26.9 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  31.17 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  26.2 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  35.05 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  30.15 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  27.04 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  31.88 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  30.15 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  36 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  32.21 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  30.15 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  25.77 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  27.51 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  31.9 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  21.64 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  28.19 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  27.17 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  31.03 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  23.68 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  24.31 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  23.68 
 
 		 231 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  26.53 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  27.86 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  26.4 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  20.53 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  24.18 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  26.21 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  29.7 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  20.44 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4622  hypothetical protein  26.5 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  34.31 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  20.79 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  22.47 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2085  hypothetical protein  25.23 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.839519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>