More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1836 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  53.95 
 
 
686 aa  721  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  95.43 
 
 
679 aa  1298  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
679 aa  1358  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
741 aa  405  1e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
742 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  34.29 
 
 
734 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
762 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  33.07 
 
 
768 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.89 
 
 
764 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
740 aa  362  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
865 aa  358  2e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
865 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  35.64 
 
 
770 aa  355  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.44 
 
 
764 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.38 
 
 
763 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
760 aa  349  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.41 
 
 
769 aa  347  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
777 aa  344  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  35.66 
 
 
769 aa  343  6e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  35.87 
 
 
769 aa  342  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  35.51 
 
 
769 aa  342  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
756 aa  340  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.94 
 
 
774 aa  340  7e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  35.17 
 
 
785 aa  339  8e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  34.81 
 
 
783 aa  338  2e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.28 
 
 
803 aa  337  5e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  34.06 
 
 
770 aa  332  1e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  35.97 
 
 
878 aa  329  1e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  37.95 
 
 
793 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.4 
 
 
789 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  32.17 
 
 
764 aa  323  5e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
770 aa  322  2e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  30.71 
 
 
752 aa  320  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
772 aa  319  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
544 aa  318  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  34.55 
 
 
864 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  34.75 
 
 
832 aa  317  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  34.55 
 
 
864 aa  317  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.55 
 
 
864 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.55 
 
 
864 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.55 
 
 
864 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.55 
 
 
864 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
766 aa  315  2e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
783 aa  314  4e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  35 
 
 
1079 aa  313  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
804 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
758 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  36.06 
 
 
561 aa  310  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
543 aa  309  1e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  34.85 
 
 
839 aa  307  4e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
649 aa  306  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
695 aa  306  9e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
777 aa  306  1e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
755 aa  304  3e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
660 aa  304  3e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
681 aa  304  3e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
769 aa  304  4e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  31.85 
 
 
601 aa  304  4e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
604 aa  303  6e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12235e-12 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  36.95 
 
 
769 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.95 
 
 
1866 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
762 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
607 aa  301  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.40814e-08 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
765 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.99 
 
 
1960 aa  299  9e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  39.6 
 
 
1089 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  34.73 
 
 
538 aa  299  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  31.53 
 
 
610 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
954 aa  299  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
777 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
1031 aa  299  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
767 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  34.14 
 
 
764 aa  298  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
705 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
688 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  9.28264e-05 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  36.33 
 
 
769 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
769 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  36.33 
 
 
769 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
801 aa  296  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
896 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
896 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
753 aa  296  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
769 aa  296  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
756 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
2539 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
544 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
705 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
750 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
598 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.8 
 
 
2336 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.84 
 
 
1992 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
1030 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  30.16 
 
 
2301 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
934 aa  290  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
781 aa  290  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  34.84 
 
 
798 aa  290  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.73 
 
 
677 aa  289  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.81 
 
 
1987 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
558 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
671 aa  288  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>