More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0171 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  75.41 
 
 		 796 aa  1179    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  63.59 
 
 		 773 aa  1015    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  96.38 
 
 		 827 aa  1600    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  50.88 
 
 		 797 aa  744    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  72.73 
 
 		 841 aa  1186    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 829 aa  1682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  45.29 
 
 		 804 aa  656    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  74.3 
 
 		 818 aa  1226    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  66.19 
 
 		 818 aa  1004    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  42.09 
 
 		 795 aa  627  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  40.49 
 
 		 802 aa  595  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  39.4 
 
 		 852 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  40.86 
 
 		 852 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  41.23 
 
 		 852 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  41.1 
 
 		 852 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  40.98 
 
 		 778 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  38.7 
 
 		 807 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  40.45 
 
 		 857 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  38.9 
 
 		 843 aa  554  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  39.28 
 
 		 831 aa  551  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  39.39 
 
 		 823 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  40.2 
 
 		 777 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  41.15 
 
 		 791 aa  548  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  39.85 
 
 		 862 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  40.77 
 
 		 793 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  38.99 
 
 		 831 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  39.05 
 
 		 830 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  39.15 
 
 		 823 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  38.53 
 
 		 807 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  38.76 
 
 		 835 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  38.2 
 
 		 819 aa  534  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  37.83 
 
 		 819 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  38.62 
 
 		 807 aa  535  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  39.52 
 
 		 830 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  38.85 
 
 		 832 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  38.19 
 
 		 833 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  39.06 
 
 		 830 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  39.55 
 
 		 851 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  38.19 
 
 		 791 aa  528  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  39.55 
 
 		 851 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  39.55 
 
 		 851 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  37.62 
 
 		 814 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  37.85 
 
 		 804 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  37.97 
 
 		 815 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  38.29 
 
 		 819 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  39.61 
 
 		 817 aa  525  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  37.62 
 
 		 814 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  38.67 
 
 		 804 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  38.07 
 
 		 809 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  37.88 
 
 		 793 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  40.7 
 
 		 794 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  40.83 
 
 		 779 aa  521  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  40.27 
 
 		 824 aa  519  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  37.76 
 
 		 793 aa  519  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  38.6 
 
 		 908 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  38.2 
 
 		 817 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  37.79 
 
 		 803 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  36.69 
 
 		 796 aa  515  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  38.95 
 
 		 805 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  38.65 
 
 		 797 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  38.98 
 
 		 804 aa  515  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  39.36 
 
 		 818 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  38.01 
 
 		 830 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  38.52 
 
 		 810 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  37.13 
 
 		 819 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  37.07 
 
 		 823 aa  510  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  38.61 
 
 		 817 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  36.97 
 
 		 835 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  39.34 
 
 		 800 aa  512  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  38.69 
 
 		 799 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  37.95 
 
 		 817 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  40.29 
 
 		 797 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 803 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  37.44 
 
 		 865 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  37.95 
 
 		 817 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 		 819 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  39.59 
 
 		 850 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  36.89 
 
 		 808 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  37.59 
 
 		 818 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  37.33 
 
 		 846 aa  505  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  39.47 
 
 		 850 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  39.47 
 
 		 850 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  39.47 
 
 		 850 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  39.82 
 
 		 803 aa  502  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  39.35 
 
 		 850 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  36.58 
 
 		 805 aa  502  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  36.58 
 
 		 839 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  35.97 
 
 		 804 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  38.43 
 
 		 799 aa  502  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  38.51 
 
 		 852 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  38.03 
 
 		 852 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  36.89 
 
 		 839 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  37.72 
 
 		 846 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  38.25 
 
 		 849 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  36.41 
 
 		 839 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  37.17 
 
 		 844 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.12 
 
 		 817 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  37.67 
 
 		 796 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  36.94 
 
 		 839 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  36.72 
 
 		 844 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>