More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5586 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
326 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  46.51 
 
 
298 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 
298 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 
298 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  45.24 
 
 
298 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  44.97 
 
 
298 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
295 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 
303 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 
303 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 
303 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
290 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 
301 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
294 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  33.46 
 
 
289 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  28.18 
 
 
292 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  30.17 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
257 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
258 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  23.79 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  29.18 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  25.56 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 
278 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  24.79 
 
 
235 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  25.39 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  23.98 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.86 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  25.56 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  27.23 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  22.73 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  26.1 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.62 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  25.74 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
294 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  25.74 
 
 
255 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  27.53 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  24.9 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  26.34 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  27.3 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  28.09 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  24.89 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.24 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  22.48 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  22.8 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  27.56 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
227 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  26.95 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
280 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  20.45 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
305 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
312 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
258 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
256 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  45.36 
 
 
243 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  28.08 
 
 
256 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.45 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>