More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2693 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
313 aa  617  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  44.98 
 
 
282 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
281 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
281 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
276 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  50.82 
 
 
257 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  42.37 
 
 
294 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  45.8 
 
 
270 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45 
 
 
275 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  46.56 
 
 
275 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  43.98 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.41 
 
 
262 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 
275 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
270 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.36 
 
 
281 aa  175  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
268 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
261 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0222  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.29 
 
 
274 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  41.92 
 
 
272 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
274 aa  158  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 
270 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
297 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2004  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.18 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
270 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
271 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
271 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
264 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.72 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.22 
 
 
279 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
257 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
273 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
287 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
264 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0712  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
226 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
269 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
293 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 
296 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
263 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.24 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.72 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.36 
 
 
263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  36.32 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  32.29 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
265 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
267 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  37.97 
 
 
276 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 
265 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
267 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
258 aa  124  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 
289 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
257 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
268 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
259 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
261 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
264 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.55 
 
 
261 aa  122  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
259 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 
309 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
267 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
259 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
256 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  33.45 
 
 
307 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
257 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>