More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2024 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 329 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  47.16 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  43.6 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.93 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2866  hypothetical protein  48.87 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.219006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  36.4 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  36.47 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  36.15 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 		 253 aa  89.4  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 286 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  29.31 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.33 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.29 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  27.24 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.43 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  29.05 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  30.1 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.17 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  33.95 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.2 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.2 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  29.04 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  28.72 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.52 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  26.3 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.25 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.2 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  29.02 
 
 		 462 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.4 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.84 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  24.32 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.79 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  27.52 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.39 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>