20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2866 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2866  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  634    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.219006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  48.87 
 
 		 329 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  33.15 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  37.66 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  31.19 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  35.71 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  46 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  35.71 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  53.33 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 366 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.38 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  39.22 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>