More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1971 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  81.55 
 
 		 224 aa  325  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  76.59 
 
 		 211 aa  301  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 213 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  67.77 
 
 		 216 aa  276  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  68.27 
 
 		 244 aa  275  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  67.48 
 
 		 231 aa  271  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  66.35 
 
 		 231 aa  270  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  65.37 
 
 		 212 aa  261  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  64.88 
 
 		 212 aa  259  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.32 
 
 		 233 aa  258  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  60.95 
 
 		 221 aa  256  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  61.24 
 
 		 216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  60.75 
 
 		 218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  64.14 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  62.63 
 
 		 213 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.3 
 
 		 226 aa  241  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.88 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 225 aa  237  9e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.94 
 
 		 218 aa  237  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.29 
 
 		 219 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  59.35 
 
 		 223 aa  226  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.84 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.34 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  53.92 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.85 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.66 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  53.62 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.66 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.48 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.88 
 
 		 216 aa  208  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  52.71 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  50.95 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  57.07 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  50.73 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.17 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  45.33 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  43 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  44.39 
 
 		 234 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  43 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  43.19 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  41.04 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  41.04 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  47.64 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.04 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  44.93 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.66 
 
 		 236 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32780  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.95 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.29 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  38.94 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 303 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1701  response regulator receiver protein  42.18 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0169479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.17 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  44.61 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.95 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.93 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>