113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1461 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 539 aa  1090    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  59.25 
 
 		 545 aa  621  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  59.25 
 
 		 545 aa  621  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  59.25 
 
 		 545 aa  621  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  59.25 
 
 		 545 aa  621  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  59.25 
 
 		 545 aa  621  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  40.96 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  40.96 
 
 		 504 aa  330  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  40.96 
 
 		 504 aa  330  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  38.96 
 
 		 522 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  32.62 
 
 		 511 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  32.62 
 
 		 511 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  31.59 
 
 		 513 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  33.14 
 
 		 508 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  27.29 
 
 		 554 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  28 
 
 		 596 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  26.72 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  26.72 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  26.72 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  26.72 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  22.52 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  22.52 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  28.42 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  28.01 
 
 		 562 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  25.5 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  26.07 
 
 		 547 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  26.07 
 
 		 548 aa  98.6  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  26.93 
 
 		 561 aa  98.6  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  26.8 
 
 		 563 aa  97.8  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  26.8 
 
 		 509 aa  97.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 563 aa  97.1  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  27.32 
 
 		 487 aa  96.7  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  26.89 
 
 		 562 aa  94.7  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  28.29 
 
 		 558 aa  94.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  28.27 
 
 		 558 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  25.89 
 
 		 548 aa  91.3  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  25.75 
 
 		 559 aa  90.9  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  25.65 
 
 		 566 aa  90.9  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 		 510 aa  90.5  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  28.84 
 
 		 579 aa  90.5  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  24.65 
 
 		 532 aa  90.5  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  24.65 
 
 		 532 aa  90.5  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  24.55 
 
 		 526 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  27.87 
 
 		 548 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  27.87 
 
 		 548 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  27.87 
 
 		 548 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2648  hypothetical protein  48.39 
 
 		 275 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  25.27 
 
 		 548 aa  87.4  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  27.3 
 
 		 555 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  23.4 
 
 		 562 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  27.8 
 
 		 540 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  27.8 
 
 		 540 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  25.38 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  26.32 
 
 		 578 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  26.32 
 
 		 578 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  26.99 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  26.32 
 
 		 578 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  23.02 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  21.73 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  21.73 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  21.73 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  21.73 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  21.73 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  25.71 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  24.04 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  24.04 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  27.03 
 
 		 642 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  24.48 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  29.44 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  31.25 
 
 		 596 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  31.25 
 
 		 596 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2657  hypothetical protein  30.45 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  31.25 
 
 		 596 aa  70.1  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 		 573 aa  68.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  26.16 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  24.59 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  22.94 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  22.94 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  22.94 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  22.94 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  22.94 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  22.94 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  22.94 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  31.98 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  33.9 
 
 		 632 aa  60.5  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  24.68 
 
 		 537 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  24.68 
 
 		 537 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2023  hypothetical protein  31.25 
 
 		 174 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0262122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25840  hypothetical protein  24.17 
 
 		 565 aa  56.2  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  23.24 
 
 		 402 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1523  transposase, IS4  22.61 
 
 		 536 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  24.94 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  24.94 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  24.94 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  24.94 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  24.94 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  24.94 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0662  transposase, IS4  33.33 
 
 		 577 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.45614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>