48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0662 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3134  transposase, IS4  100 
 
 
577 aa  1194    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2539  transposase, IS4  100 
 
 
577 aa  1194    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.288915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0274  transposase, IS4  100 
 
 
577 aa  1194    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0266253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0555  transposase, IS4  100 
 
 
577 aa  1194    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218237  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0662  transposase, IS4  100 
 
 
577 aa  1194    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.45614  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1070  transposase, IS4  100 
 
 
577 aa  1194    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0734181  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2852  transposase  30.11 
 
 
574 aa  261  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1783  transposase  29.98 
 
 
574 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1148  hypothetical protein  24.33 
 
 
556 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0396  hypothetical protein  24.15 
 
 
557 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.059615  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  20.77 
 
 
538 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  20.77 
 
 
538 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  20.77 
 
 
538 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  20.77 
 
 
538 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  20.77 
 
 
538 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  20.77 
 
 
538 aa  81.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  19.96 
 
 
537 aa  77.4  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  19.96 
 
 
537 aa  77.4  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  21.35 
 
 
572 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  21.35 
 
 
572 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  28.47 
 
 
544 aa  57.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  28.47 
 
 
544 aa  57.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  19.51 
 
 
537 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  19.51 
 
 
537 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  19.51 
 
 
537 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  19.51 
 
 
537 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  19.51 
 
 
537 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  19.51 
 
 
537 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  19.51 
 
 
537 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  19.51 
 
 
537 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  19.51 
 
 
537 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  36.54 
 
 
508 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  36.54 
 
 
508 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3021  hypothetical protein  23.65 
 
 
371 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
539 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  31.58 
 
 
513 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  19.46 
 
 
562 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  29.53 
 
 
402 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  23.49 
 
 
566 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  19.69 
 
 
562 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  31.03 
 
 
359 aa  43.9  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  20.36 
 
 
548 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  22.77 
 
 
531 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  20.36 
 
 
548 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  20.36 
 
 
548 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  22.77 
 
 
531 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  31.13 
 
 
511 aa  43.5  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  31.13 
 
 
511 aa  43.5  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>