37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2698 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1014    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  35.64 
 
 		 537 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  46.69 
 
 		 363 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  44.84 
 
 		 519 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  36.9 
 
 		 519 aa  193  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  34.78 
 
 		 484 aa  186  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  61.22 
 
 		 535 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  62.77 
 
 		 346 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  35.07 
 
 		 503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  68.64 
 
 		 255 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  33.79 
 
 		 526 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  55.86 
 
 		 527 aa  156  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  65.65 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  54.25 
 
 		 181 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  35.65 
 
 		 411 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  39.22 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  56.25 
 
 		 175 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  51.74 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  36.51 
 
 		 403 aa  124  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  36.86 
 
 		 288 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  36.54 
 
 		 369 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 335 aa  97.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  61.45 
 
 		 148 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  30.15 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  25.95 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  31.5 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  28.12 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  30.05 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  31.45 
 
 		 505 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  27.92 
 
 		 434 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  29.39 
 
 		 432 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  29.84 
 
 		 412 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  34.75 
 
 		 228 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  33.64 
 
 		 181 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  27.71 
 
 		 478 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>