More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1409 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  69.76 
 
 		 839 aa  765    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 670 aa  1321    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  50.17 
 
 		 638 aa  510  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  47.88 
 
 		 727 aa  481  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.03 
 
 		 702 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.11 
 
 		 583 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  42.93 
 
 		 653 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.29 
 
 		 655 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.4 
 
 		 635 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.67 
 
 		 682 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  42.88 
 
 		 586 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.43 
 
 		 692 aa  382  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.91 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.62 
 
 		 581 aa  365  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.69 
 
 		 754 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.29 
 
 		 662 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.04 
 
 		 677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  42.18 
 
 		 716 aa  355  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.74 
 
 		 716 aa  355  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.21 
 
 		 618 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  38.78 
 
 		 657 aa  353  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.81 
 
 		 637 aa  351  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.99 
 
 		 663 aa  350  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.61 
 
 		 553 aa  350  7e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  39.83 
 
 		 656 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.88 
 
 		 657 aa  345  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 635 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  37.39 
 
 		 679 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.95 
 
 		 579 aa  338  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  36.74 
 
 		 652 aa  335  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  37.12 
 
 		 657 aa  334  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.3 
 
 		 654 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  38.33 
 
 		 708 aa  332  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 		 642 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  38.37 
 
 		 657 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 		 642 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 		 642 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  38 
 
 		 729 aa  326  7e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.96 
 
 		 635 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  36.36 
 
 		 695 aa  324  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  37.64 
 
 		 660 aa  323  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 600 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  38.18 
 
 		 583 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.08 
 
 		 634 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 586 aa  318  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.35 
 
 		 600 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  37.48 
 
 		 552 aa  313  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  37.46 
 
 		 548 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  36.54 
 
 		 579 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.51 
 
 		 570 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  36.36 
 
 		 579 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 		 582 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  35.59 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 		 654 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  35.85 
 
 		 578 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.6 
 
 		 588 aa  306  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  35.83 
 
 		 583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  36.7 
 
 		 613 aa  303  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 		 613 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  38.77 
 
 		 671 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.8 
 
 		 571 aa  300  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 578 aa  300  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.37 
 
 		 584 aa  300  8e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  35.75 
 
 		 631 aa  299  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 		 582 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 582 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 		 576 aa  296  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 		 578 aa  296  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  38.3 
 
 		 575 aa  295  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  35.54 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  38.31 
 
 		 570 aa  294  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  36.89 
 
 		 711 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  36.08 
 
 		 682 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  33.85 
 
 		 565 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 578 aa  293  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  35.7 
 
 		 740 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  33.85 
 
 		 565 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  35.13 
 
 		 578 aa  291  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.97 
 
 		 570 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 		 614 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 587 aa  290  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  34.64 
 
 		 575 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1250  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.83 
 
 		 592 aa  289  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0497738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  35.7 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  34.82 
 
 		 580 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 		 584 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  36.16 
 
 		 568 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  33.99 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 		 584 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 		 584 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 		 584 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  35.71 
 
 		 575 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 		 587 aa  288  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  33.81 
 
 		 588 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.81 
 
 		 588 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.81 
 
 		 588 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  33.81 
 
 		 588 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  33.81 
 
 		 588 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 588 aa  286  7e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  34.27 
 
 		 578 aa  286  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>