More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1145 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  69.84 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  52.94 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  59.81 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  47.48 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  51.52 
 
 		 153 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  53.33 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  53.33 
 
 		 191 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  51.26 
 
 		 159 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  51.26 
 
 		 167 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  53.28 
 
 		 171 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  54.17 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  50.42 
 
 		 192 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  53.72 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  51.26 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  52.94 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  50.42 
 
 		 170 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  49.58 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  51.26 
 
 		 165 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  52.94 
 
 		 175 aa  131  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  51.26 
 
 		 193 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  51.28 
 
 		 156 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  48.74 
 
 		 166 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  50.86 
 
 		 164 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  48.74 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  50.86 
 
 		 172 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  50.86 
 
 		 172 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  50.86 
 
 		 172 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  49.58 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  50.42 
 
 		 189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  49.58 
 
 		 188 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  63.44 
 
 		 182 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  49.14 
 
 		 173 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  50.42 
 
 		 182 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  47.9 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  50.47 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  51.26 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 177 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  48.74 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  49.58 
 
 		 170 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 178 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  49.59 
 
 		 179 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  43.55 
 
 		 193 aa  113  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  43.54 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  44.64 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  45.08 
 
 		 148 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  43.1 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  42.48 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  40.16 
 
 		 148 aa  101  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  41.43 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  43.44 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  43.97 
 
 		 201 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 174 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  42.73 
 
 		 118 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  41.44 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  40.31 
 
 		 183 aa  89.7  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  39.5 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  35.45 
 
 		 151 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  40.34 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  40.34 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  40.34 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  39.55 
 
 		 185 aa  85.5  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 165 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  37.19 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  37.9 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  37.59 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  32.87 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  38.04 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  38.14 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  35 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  36.7 
 
 		 157 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  35 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  36 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  39.56 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  38 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  39 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  36 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 186 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  34 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>